a 2008

Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

STROUHAL, Michal; Lenka MIKALOVÁ; Petra MATĚJKOVÁ a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

Název česky

Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

Název anglicky

Structure differences in genomes of chosen Treponema genus representatives.

Autoři

STROUHAL, Michal (203 Česká republika); Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika); Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)

Vydání

Brno, Tomáškovy dny 2008, sborník abstraktů. od s. 38-39, 2 s. 2008

Nakladatel

Mikrobiologický ústav LF MU

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/08:00024752

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum; whole genome fingerprinting
Změněno: 26. 6. 2009 14:22, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

V originále

Rod Treponema zahrnuje zástupce s různou mírou invazivity a patogenity. T. pallidum subsp. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka. Endemické nevenerické treponemální infekce tropických a subtropických oblastí vyvolávají T. pallidum subsp. pertenue (způsobující yaws) a T. pallidum subsp. endemicum (způsobující endemickou syfilis). Blízce příbuzný druh T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a není infekční pro člověka. Genomy 9 zástupců zahrnující kmeny Mexico A, Street strain 14, DAL-1 (T. p. pallidum), Samoa D, Gauthier, CDC-2 (T. p. pertenue), Bosnia A (T. p. endemicum), Fribourg-Blanc (taxonomicky blíže nespecifikovaný opičí izolát) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi) byly porovnány pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) s genomem kmene Nichols (T. p. pallidum), jehož komletní nukleotidová sekvence je známa. Získané restrikční profily byly použity k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. U kmenů Mexico A, DAL-1, Gauthier, CDC-2, Fribourg-Blanc bylo zatím analyzováno 71 % genomu, u kmene Bosnia A 46 %.

Anglicky

Structure differences in the genomes of several Treponema strains is presented.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů