GOJOVA, Lucie, Eva JANSOVA, Maigi KULM, Slavka POUCHLA a Libor KOZÁK. Genotyping microarray as a novel approach for the detection of ATP7B gene mutations in patients with Wilson disease. Clinical Genetics. Denmark: Blackwell Munksgaard, 2008, roč. 73, č. 5, s. 441-52, 12 s. ISSN 0009-9163.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Genotyping microarray as a novel approach for the detection of ATP7B gene mutations in patients with Wilson disease
Název česky Genotypovací microarray jako nový přístup v detekci mutací v ATP7B genu u pacientů s Wilsonovou chorobou
Autoři GOJOVA, Lucie (203 Česká republika), Eva JANSOVA (203 Česká republika), Maigi KULM (233 Estonsko), Slavka POUCHLA (203 Česká republika) a Libor KOZÁK (203 Česká republika, garant).
Vydání Clinical Genetics, Denmark, Blackwell Munksgaard, 2008, 0009-9163.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Dánsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.206
Kód RIV RIV/00216224:14310/08:00026048
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000254788800007
Klíčová slova anglicky Wilson chip; microarrays; Wilson disease; APEX technology; ATP7B gene
Štítky APEX technology, ATP7B gene, microarrays, Wilson chip, Wilson disease
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: doc. RNDr. Lenka Fajkusová, CSc., učo 29792. Změněno: 9. 6. 2008 10:18.
Anotace
Wilson disease (WD) is an autosomal recessive inherited disorder of copper metabolism, which is caused by mutations in the ATP7B gene. To date, more than 300 mutations have been described in this gene. Molecular diagnostics of Wilson disease utilizes restriction enzyme digestion, MLPA or a direct sequencing. To simplify and speed up the screening of ATP7B mutations, we have developed a genotyping microarray for the simultaneous detection of 87 mutations and 17 polymorphisms in the ATP7B gene based on the arrayed primer extension reaction (APEX). The Wilson microarray was validated by screening 97 previously genetically confirmed WD patients. In total, we detected 43 mutations and 15 polymorphisms, which represent a majority of the common mutations occurring in the Czech and Slovak populations. The Wilson chip appears to be a rapid, sensitive and cost-effective tool for the first line screening of potential WD patients.
Anotace česky
Wilsonova choroba (WCH) je závažné autosomálně recesivní onemocnění, jehož podstatou jsou mutace v ATP7B genu, který kóduje měď-specifickou ATPásu. Běžné molekulárně genetické vyšetření WCH je založeno na využití metod PCR/RFLP, MLPA a přímé sekvenování. Ve spolupráci s firmou Asper Biotech Ltd. byl vyvinut genotypovací čip umožňující souběžné stanovení 87 mutací a 17 polymorfismů v ATP7B genu. Spolehlivost čipu správně detekovat dané mutace/polymorfismy byla ověřena ve dvou fázích. Validace čipu byla testována na souboru 97 WD pacientů již s předem známým genotypem. Celkově bylo určeno 44 mutací a 15 polymorfismů reprezentujících nejčastější mutace vyskytující se v české a slovenské populaci. Wilsonův čip by tak mohl v budoucnu představovat vhodný nástroj pro rychlejší a levnější screening mutací v ATP7B genu u pacientů s Wilsonovou chorobou.
Návaznosti
LC06023, projekt VaVNázev: Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
NR8451, projekt VaVNázev: Využití DNA čipů (microarrays) při molekulární diagnostice dědičných onemocnění
VytisknoutZobrazeno: 6. 5. 2024 04:20