a 2008

PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.

FLASAROVÁ, Magdalena a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.

Název anglicky

PCR detection and subtyping of Treponema pallidum in biological specimens.

Autoři

FLASAROVÁ, Magdalena (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant)

Vydání

Tomáškovy dny 2008. Sborník abstraktů. 2008

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14110/08:00024818

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova anglicky

Treponema pallidum; syphilis; PCR detection; nested PCR; clinical samples

Štítky

Změněno: 26. 6. 2009 14:13, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Cílem práce bylo izolovat a detegovat DNA původce syfilis Treponema pallidum poddruhu pallidum z různých typů klinického materiálu od pacientů v různých stádiích syfilis a jednotlivé získané izoláty následně typizovat. Celkem bylo vyšetřeno 333 klinických vzorků od 213 pacientů, z toho 144 sér od 117 pacientů, 72 stěrů od 58 pacientů, 67 sraženin od 61 pacientů, 44 vzorků plné krve od 41 pacientů, 2 tkáně od 2 pacientů, 2 likvory od 2 pacientů a 2 punktáty od 2 pacientů. Celkem bylo vyšetřeno 5 vzorků od 3 novorozenců s kongenotální syfilis. U všech klinických izolátů byla provedena detekce treponemální DNA pomocí dvoukrokové (nested) PCR na gen tmpC (TP0316;kódující membránový lipoprotein) a na gen polA (TP0105;kódující DNA polymerázu 1). Pro typizaci PCR pozitivních klinických vzorků byly amplifikovány části genů TP0136, TP0548, a to primery unikátními pro T. pallidum a vzniklé PCR produkty byly sekvenovány dideoxyterminátorovou metodou.

Anglicky

Detection of the spirochete Treponema pallidum in clinical samples is described and discussed.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů