J 2008

TRITON: a graphical tool for ligand-binding protein engineering

PROKOP, Martin, Jan ADAM, Zdeněk KŘÍŽ, Michaela WIMMEROVÁ, Jaroslav KOČA et. al.

Základní údaje

Originální název

TRITON: a graphical tool for ligand-binding protein engineering

Název česky

TRITON: a graphical tool for ligand-binding protein engineering

Autoři

PROKOP, Martin (203 Česká republika), Jan ADAM (203 Česká republika), Zdeněk KŘÍŽ (203 Česká republika), Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant)

Vydání

Bioinformatics, Oxford University Press, 2008, 1367-4803

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 4.328

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00024908

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000258860700021

Klíčová slova anglicky

software development; protein engineering; protein-ligand docking;

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 24. 6. 2009 12:57, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Summary: The new version of the TRITON program provides user-friendly graphical tools for modeling protein mutants using the external program MODELLER and for docking ligands into the mutants using the external program AutoDock. TRITON can now be used to design ligand-binding proteins, to study protein-ligand binding mechanisms or simply to dock any ligand to a protein. Availability: Executable files of TRITON are available free of charge for academic users at http://ncbr.chemi.muni.cz/triton/ Contact: triton@chemi.muni.cz Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.

Česky

Summary: The new version of the TRITON program provides user-friendly graphical tools for modeling protein mutants using the external program MODELLER and for docking ligands into the mutants using the external program AutoDock. TRITON can now be used to design ligand-binding proteins, to study protein-ligand binding mechanisms or simply to dock any ligand to a protein. Availability: Executable files of TRITON are available free of charge for academic users at http://ncbr.chemi.muni.cz/triton/ Contact: triton@chemi.muni.cz Supplementary information: Supplementary data are available at Bioinformatics online.

Návaznosti

GA303/06/0570, projekt VaV
Název: Strukturně-funkční studie lektinů a adhezinů patogenních mikroorganismů
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturně-funkční studie lektinů a adhezinů patogenních mikroorganismů
LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím