D 2008

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN et. al.

Základní údaje

Originální název

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

Název česky

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

Název anglicky

Gene expression of Hsp110 is up-regulated during colorectal cancer progression

Autoři

SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN, Milana ŠACHLOVÁ, Tamara ŠMERDOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ a Rostislav VYZULA

Vydání

2008. vyd. Praha, XXI. Biochemický sjezd - Sborník přednášek a posterů, od s. 93-93, 1 s. 2008

Nakladatel

Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

ISBN

80-86313-21-2

Klíčová slova anglicky

colorectal cancer; staging; lymph nodes; progression; gene expression profiles; Hsp110

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 30. 9. 2008 09:37, prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Anotace

V originále

Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.

Anglicky

Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.

Návaznosti

NR9076, projekt VaV
Název: Genomické profilování v predikci odpovědi na chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem konečníku