KOMÁREK, Jan, Lenka MALINOVSKÁ a Michaela WIMMEROVÁ. Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní. In XXI. biochemický sjezd, program, sborník přednášek a posterů. České Budějovice: Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii, 2008, s. 190-190. ISBN 80-86313-21-2.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní
Název anglicky Bioinformatical search of lectins from molds and mushrooms
Autoři KOMÁREK, Jan, Lenka MALINOVSKÁ a Michaela WIMMEROVÁ.
Vydání České Budějovice, XXI. biochemický sjezd, program, sborník přednášek a posterů, od s. 190-190, 1 s. 2008.
Nakladatel Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 80-86313-21-2
Klíčová slova anglicky lectins; bioinformatics;
Štítky bioinformatics, Lectins
Příznaky Mezinárodní význam
Změnil Změnil: Mgr. Jan Komárek, Ph.D., učo 175127. Změněno: 3. 10. 2008 12:40.
Anotace
Lektiny jsou proteiny nebo glykoproteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá bioinformatickým vyhledáváním a analýzou lektinů z hub a plísní. Na základě sekvenční podobnosti byly identifikovány houbové proteiny podobné známým lektinům. Pro nalezené potenciální lektiny a proteiny s lektinovou doménou byla predikována 3D struktura. Většina proteinů vykazovala strukturní podobnost s lektiny zařazenými do některé z rodin houbových lektinů (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes a ricinová rodina) a je pravděpodobné, že se jedná o nové zástupce těchto rodin. Dále byly nalezeny houbové proteiny podobné lektinům z L. sulphureus, S. sclerotiorum a P. velutina a rostlinným mannosa-specifickým lektinům.
Anotace anglicky
Lectins are multivalent proteins or glycoproteins of non-immunogenic origin which recognize and bind reversibly to diverse sugar structures. This study deals with bioinformatical search and analysis of lectins from molds and mushrooms. Fungal proteins similar to known lectins were identified based on sequence similarity. 3D structures of potential lectins and proteins with lectin domain were predicted. Majority of proteins share structure similarity with lectins classified into fungal lectin families (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes and ricin family). They are probably new members of fungal lectin families. There were also identified fungal proteins similar to lectins from L. sulphureus, S. sclerotiorum and P. velutina as well as to plant mannose specific lectins.
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 31. 7. 2024 06:22