2008
Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní
KOMÁREK, Jan, Lenka MALINOVSKÁ a Michaela WIMMEROVÁZákladní údaje
Originální název
Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní
Název anglicky
Bioinformatical search of lectins from molds and mushrooms
Autoři
Vydání
České Budějovice, XXI. biochemický sjezd, program, sborník přednášek a posterů, od s. 190-190, 1 s. 2008
Nakladatel
Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
80-86313-21-2
Klíčová slova anglicky
lectins; bioinformatics;
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam
Změněno: 3. 10. 2008 12:40, Mgr. Jan Komárek, Ph.D.
V originále
Lektiny jsou proteiny nebo glykoproteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá bioinformatickým vyhledáváním a analýzou lektinů z hub a plísní. Na základě sekvenční podobnosti byly identifikovány houbové proteiny podobné známým lektinům. Pro nalezené potenciální lektiny a proteiny s lektinovou doménou byla predikována 3D struktura. Většina proteinů vykazovala strukturní podobnost s lektiny zařazenými do některé z rodin houbových lektinů (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes a ricinová rodina) a je pravděpodobné, že se jedná o nové zástupce těchto rodin. Dále byly nalezeny houbové proteiny podobné lektinům z L. sulphureus, S. sclerotiorum a P. velutina a rostlinným mannosa-specifickým lektinům.
Anglicky
Lectins are multivalent proteins or glycoproteins of non-immunogenic origin which recognize and bind reversibly to diverse sugar structures. This study deals with bioinformatical search and analysis of lectins from molds and mushrooms. Fungal proteins similar to known lectins were identified based on sequence similarity. 3D structures of potential lectins and proteins with lectin domain were predicted. Majority of proteins share structure similarity with lectins classified into fungal lectin families (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes and ricin family). They are probably new members of fungal lectin families. There were also identified fungal proteins similar to lectins from L. sulphureus, S. sclerotiorum and P. velutina as well as to plant mannose specific lectins.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
|