Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of
Streptococcus mutans

J 2008

Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans

ŠVEC, Pavel, Dana NOVÁKOVÁ, Lenka ŽÁČKOVÁ, Martina KUKLETOVÁ, Ivo SEDLÁČEK et. al.

Základní údaje

Originální název

Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans

Název česky

(GTG)5-PCR pro rychlou identifikaci druhu Streptococcus mutans

Autoři

ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant), Dana NOVÁKOVÁ (203 Česká republika), Lenka ŽÁČKOVÁ (203 Česká republika), Martina KUKLETOVÁ (203 Česká republika) a Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika)

Vydání

Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology, Springer, 2008, 0003-6072

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 1.673

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00026509

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000259670400008

Klíčová slova anglicky

Dental caries; (GTG)5-PCR; Identification; Automated ribotyping; Streptococcus mutans

Štítky

(GTG)5-PCR, automated ribotyping, dental caries, identification, Streptococcus mutans

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

Změněno: 18. 6. 2009 12:09, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

Repetitive sequence-based polymerase chain reaction (PCR) fingerprinting using the (GTG)5 primer was applied for fast screening of bacterial strains isolated from dental plaque of early childhood caries (ECC)-affected children. A group of 29 Gram-positive bacteria was separated into a homogeneous cluster together with Streptococcus mutans reference strains and constituted an aberrant branch after the numerical analysis of (GTG)5-PCR fingerprints. Automated ribotyping with EcoRI restriction enzyme (RiboPrinter microbial characterization system) revealed high genetic heterogeneity among the tested group and proved to be a good tool for strain-typing purposes. Further characterization of the studied strains was achieved by extensive phenotyping and whole-cell protein fingerprinting and confirmed all the strains as S. mutans representatives. Obtained results showed rep-PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer to be a fast and reliable method for identification of S. mutans.

Česky

Metoda rep-PCR s primerem (GTG)5 byla použita pro analýzu bakterií izolovaných ze zubního kazu dětí. Tyto kmeny byly dále analyzovány automatickou ribotypizací (RiboPrinter) a analýzou celkových buněčných proteinů. Na základě získaných výsledků se (GTG)5-PCR ukázala jako vhodná pro identifikaci druhu Streptococcus mutans.

Návaznosti

MSM0021622416, záměr

Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase

1M0528, projekt VaV

Název: Stomatologické výzkumné centrum

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Stomatologické výzkumné centrum

Citovat

ŠVEC, Pavel, Dana NOVÁKOVÁ, Lenka ŽÁČKOVÁ, Martina KUKLETOVÁ a Ivo SEDLÁČEK. Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans. Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology. Springer, 2008, roč. 94, č. 4, s. 573-579. ISSN 0003-6072.

@article{781895,
   author = {Švec, Pavel and Nováková, Dana and Žáčková, Lenka and Kukletová, Martina and Sedláček, Ivo},
   article_number = {4},
   keywords = {Dental caries; (GTG)5-PCR; Identification; Automated ribotyping; Streptococcus mutans},
   language = {eng},
   issn = {0003-6072},
   journal = {Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology},
   title = {Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans},
   url = {http://www.springerlink.com/content/268q817531426227/?p=e909337e76ae416fbddd48f749191788&pi=7},
   volume = {94},
   year = {2008}
}

TY  - JOUR
ID  - 781895
AU  - Švec, Pavel - Nováková, Dana - Žáčková, Lenka - Kukletová, Martina - Sedláček, Ivo
PY  - 2008
TI  - Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans
JF  - Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology
VL  - 94
IS  - 4
SP  - 573-579
EP  - 573-579
PB  - Springer
SN  - 00036072
KW  - Dental caries
KW  - (GTG)5-PCR
KW  - Identification
KW  - Automated ribotyping
KW  - Streptococcus mutans
UR  - http://www.springerlink.com/content/268q817531426227/?p=e909337e76ae416fbddd48f749191788&pi=7
N2  - Repetitive sequence-based polymerase chain reaction (PCR) fingerprinting using the (GTG)5 primer was applied for fast screening of bacterial strains isolated from dental plaque of early childhood caries (ECC)-affected children. A group of 29 Gram-positive bacteria was separated into a homogeneous cluster together with Streptococcus mutans reference strains and constituted an aberrant branch after the numerical analysis of (GTG)5-PCR fingerprints. Automated ribotyping with EcoRI restriction enzyme (RiboPrinter microbial characterization system) revealed high genetic heterogeneity among the tested group and proved to be a good tool for strain-typing purposes. Further characterization of the studied strains was achieved by extensive phenotyping and whole-cell protein fingerprinting and confirmed all the strains as S. mutans representatives. Obtained results showed rep-PCR fingerprinting with the (GTG)5 primer to be a fast and reliable method for identification of S. mutans.
ER  -

ŠVEC, Pavel, Dana NOVÁKOVÁ, Lenka ŽÁČKOVÁ, Martina KUKLETOVÁ a Ivo SEDLÁČEK. Evaluation of (GTG)5-PCR for rapid identification of Streptococcus mutans. \textit{Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology}. Springer, 2008, roč.~94, č.~4, s.~573-579. ISSN~0003-6072.

Podrobný výpis o publikaci