Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size

ŠMERDA, Jakub, Petr ŠMARDA, Lucie HOROVÁ a Petr BUREŠ. Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size. In The Comparative Biology of Monocotyledons. 2008. ISBN 978-87-87772-03-7.

Základní údaje

• Originální název: Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size
• Název česky: Kvantifikace retrostransposonů v populaci Festuca pallens s variabilní velikostí genomu
• Autoři: ŠMERDA, Jakub (203 Česká republika, garant, domácí), Petr ŠMARDA (203 Česká republika, domácí), Lucie HOROVÁ (203 Česká republika, domácí) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: The Comparative Biology of Monocotyledons, 2008.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Dánsko
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/08:00024946
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 978-87-87772-03-7
• Klíčová slova anglicky: Ty1-copia; Ty3-gypsy; quantitative PCR
• Štítky: quantitative PCR, Ty1-copia, Ty3-gypsy
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Variation in genome size found within species and populations offers unique possibility to study ongoing processes of genome size evolution. In a Festuca pallens population with the constant chromosome number we documented recently a high variation in genome size (up to 1.188-fold) that we assume to be a probable consequence of recent retrotransposon activity. Here we tested this hypothesis by studying sequence diversity and copy number of some candidate retrotransposon types in several seedlings with constrasting genome sizes.

Anotace česky

Variation in genome size found within species and populations offers unique possibility to study ongoing processes of genome size evolution. In a Festuca pallens population with the constant chromosome number we documented recently a high variation in genome size (up to 1.188-fold) that we assume to be a probable consequence of recent retrotransposon activity. Here we tested this hypothesis by studying sequence diversity and copy number of some candidate retrotransposon types in several seedlings with constrasting genome sizes.

Návaznosti

• GP206/08/P222, projekt VaV: Název: Evoluce GC obsahu a genomu trav

Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav

• LC06073, projekt VaV: Název: Centrum pro výzkum biodiverzity

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity

• MSM0021622416, záměr: Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase