Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice
stafylokoků

a 2008

Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ

Základní údaje

Originální název

Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků

Autoři

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ

Vydání

Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008" 2008

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

horizontal gene transfer; Staphylococcus aureus; molecular diagnostics

Štítky

horizontal gene transfer, Molecular diagnostics, Staphylococcus aureus

Změněno: 13. 10. 2008 12:46, prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Značná část genů zodpovědných za virulenci a rezistenci druhu Staphylococcus aureus je lokalizována na mobilních genetických elementech (MGE), které představují významnou složku genomu většiny kmenů. MGE tvoří obvykle 10-20 % genomu S. aureus a patří k nim bakteriofágy, ostrovy patogenity, plazmidy, chromozomové kazety a transpozony. U různých kmenů je přítomnost jednotlivých typů elementů velmi variabilní a je zdrojem genetického polymorfismu využitelného k jejich identifikaci. K bližší charakterizaci a detailní typizaci kmenů jsou MGE využívány především v lokálních epidemiologických studiích, kde pro vysokou míru genetické příbuznosti kmenů nejsou standardně používané metody (PFGE, spa-typizace) dostatečně citlivé. Detekce MGE je též důležitou doplňkovou metodou diagnostiky kmenů S. aureus, která umožňuje podrobnou charakteristiku izolátů z hlediska sledování šíření determinant virulence a rezistence k antibiotikům. V současnosti jsou nejvíce využívány metodiky založené na vyhledávání genů nesených na MGE pomocí PCR, které jsou finančně dostupné, dostatečně citlivé, časově a instrumentálně nenáročné. Pozornost je věnována především detekci specifických genů a sekvencí jednotlivých druhů bakteriofágů, plazmidů a u meticilin rezistentních kmenů (MRSA) také na charakterizaci typu chromozomové kazety SCCmec.

Anglicky

neuvedeno

Návaznosti

MSM0021622415, záměr

Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Citovat

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků. In Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008". 2008.

@proceedings{784055,
   author = {Kuntová, Lucie and Kahánková, Jana and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří},
   booktitle = {Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008"},
   keywords = {horizontal gene transfer; Staphylococcus aureus; molecular diagnostics},
   language = {cze},
   note = {PLIVA - Lachema Diagnostika s.r.o., Československá společnost mikrobiologická, Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP, Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii ČLS JEP, Česká sbírka mikroorganismů PřF MU Brno. Teze referátů str. 14},
   title = {Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků},
   url = {http://www.splm.cz/dokumenty/Sympozium_158.doc},
   year = {2008}
}

TY  - CONF
ID  - 784055
AU  - Kuntová, Lucie - Kahánková, Jana - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří
PY  - 2008
TI  - Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků
N1  - PLIVA - Lachema Diagnostika s.r.o., Československá společnost mikrobiologická, Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP, Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii ČLS JEP, Česká sbírka mikroorganismů PřF MU Brno. Teze referátů str. 14
KW  - horizontal gene transfer
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - molecular diagnostics
UR  - http://www.splm.cz/dokumenty/Sympozium_158.doc
N2  - Značná část genů zodpovědných za virulenci a rezistenci druhu Staphylococcus aureus je lokalizována na mobilních genetických elementech (MGE), které představují významnou složku genomu většiny kmenů. MGE tvoří obvykle 10-20 % genomu S. aureus a patří k nim bakteriofágy, ostrovy patogenity, plazmidy, chromozomové kazety a transpozony. U různých kmenů je přítomnost jednotlivých typů elementů velmi variabilní a je zdrojem genetického polymorfismu využitelného k jejich identifikaci. K bližší charakterizaci a detailní typizaci kmenů jsou MGE využívány především v lokálních epidemiologických studiích, kde pro vysokou míru genetické příbuznosti kmenů nejsou standardně používané metody (PFGE, spa-typizace) dostatečně citlivé. Detekce MGE je též důležitou doplňkovou metodou diagnostiky kmenů S. aureus, která umožňuje podrobnou charakteristiku izolátů z hlediska sledování šíření determinant virulence a rezistence k antibiotikům. V současnosti jsou nejvíce využívány metodiky založené na vyhledávání genů nesených na MGE pomocí PCR, které jsou finančně dostupné, dostatečně citlivé, časově a instrumentálně nenáročné. Pozornost je věnována především detekci specifických genů a sekvencí jednotlivých druhů bakteriofágů, plazmidů a u meticilin rezistentních kmenů (MRSA) také na charakterizaci typu chromozomové kazety SCCmec.
ER  -

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK a Jiří DOŠKAŘ. Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků. In \textit{Pracovní dny LACHEMA ''Mikrobiální identifikace 2008''}. 2008.

Podrobný výpis o publikaci