p 2008

Identifikace a typizace bakterií systémem RiboPrinter.

ŠVEC, Pavel

Základní údaje

Originální název

Identifikace a typizace bakterií systémem RiboPrinter.

Název anglicky

Identification and typing of bacteria by using the RiboPrinter system.

Autoři

Vydání

Sympózium Mikrobiální identifikace 2008, 2008

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Vyžádané přednášky

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta
Změněno: 15. 10. 2008 11:10, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.

Anotace

ORIG EN

V originále

Ribotypizace je druhově až kmenově specifická molekulárně-biologická metoda využívaná v taxonomii bakterií. Je založená na selektivní hybridizaci a následné detekci restrikčních fragmentů nesoucích geny pro ribozomální RNA. Ribotypizace byla popsána a poprvé použita pro identifikaci bakterií v roce 1986 (Grimont a Grimont, 1986, Ann. Inst. Pasteur/Microbiol., 137B: 165-175) a v následujících letech byla aplikována pro typizaci různých bakteriálních skupin. Její provedení - tzv. manuální ribotypizace - je však časově i instrumentálně náročný proces, často s nízkou mezilaboratorní reprodukovatelností výsledků. Automatizace ribotypizace byla umožněna komerčním systémem RiboPrinter Microbial Identification System (DuPont Qualicon, USA), který významně urychluje celý proces ribotypizace a poskytuje vysoce standardní výsledky. RiboPrinter umožňuje jednak charakterizaci kmene (to je stanovení ribotypu) a díky dodávané databázi ribotypů, obsahující 6448 ribotypů referenčních bakteriálních kmenů, také eventuální identifikaci neznámého izolátu. V rámci této přednášky budou popsány základní principy, postup provedení a výhody i nevýhody manuální a automatické ribotypizace. Jako příklad využití systému RiboPrinter budou prezentovány výsledky automatické ribotypizace zástupců druhu Streptococcus mutans z humánního klinického materiálu. Podpořeno projekty MSM0021622416 a 1M0528.

Anglicky

Identification and typing of bacteria by using the RiboPrinter system.

Návaznosti

MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
1M0528, projekt VaV
Název: Stomatologické výzkumné centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Stomatologické výzkumné centrum