2008
Conformational Transitions of Flanking Purines in HIV-1 RNA Dimerization Initiation Site Kissing Complexes Studied by Charmm Explicit Solvent Molecular Dynamics
SARZYNSKA, Joanna, Kamila REBLOVA, Jiri SPONER a Tadeusz KULINSKIZákladní údaje
Originální název
Conformational Transitions of Flanking Purines in HIV-1 RNA Dimerization Initiation Site Kissing Complexes Studied by Charmm Explicit Solvent Molecular Dynamics
Název česky
Konformační přechody volných purinů v HIV-1 RNA kissing complexech studovaných molekulově dynamickými simulacemi v explicitním solventu pomocí Charmmu
Autoři
SARZYNSKA, Joanna (616 Polsko), Kamila REBLOVA (203 Česká republika), Jiri SPONER (203 Česká republika, garant) a Tadeusz KULINSKI (616 Polsko)
Vydání
Biopolymers, Wiley InterScience, 2008, 0006-3525
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10610 Biophysics
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.823
Kód RIV
RIV/00216224:14310/08:00026548
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000257822000003
Klíčová slova anglicky
molecular dynamics methods; RNA
Štítky
Změněno: 24. 6. 2009 10:12, Mgr. Kamila Réblová, Ph.D.
V originále
Study of flanking bases in RNA kissing loop complexes using Charmm force field shows good agreement with experiments carried out by Amber and with X-ray crystalography. The study describes multiple conformations, which flanking bases may adopt on nanosecond time scale.
Česky
Studium volných bází v kissing komplexech RNA pomocí silového pole Charmm ukazuje shodu s experimenty prováděnými pomocí Amberu a s rentgenovou krystalografií. Studie popisuje množství konformací, které mohou volné báze zaujmout na nanosekundové časové škále.
Návaznosti
| MSM0021622413, záměr |
|