J 2008

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

BROŽKOVÁ, Kristýna, Eva BUDINSKÁ, Pavel BOUCHAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

Název česky

Proteinové profilování karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS odhaluje klinickopatologicky relevantní skupiny pacientů stejně jako dříve definované klastry na základě exprese cDNA

Autoři

BROŽKOVÁ, Kristýna (203 Česká republika, domácí), Eva BUDINSKÁ (703 Slovensko, domácí), Pavel BOUCHAL (203 Česká republika, domácí), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Česká republika), Dana KNOFLÍČKOVÁ (203 Česká republika), Dalibor VALÍK (203 Česká republika, domácí), Rostislav VYZULA (203 Česká republika, domácí), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Česká republika) a Rudolf NENUTIL (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Breast Cancer Research, London, Great Britain, Biomed Central Ltd. 2008, 1465-5411

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 5.052

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00028249

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000257869600016

Klíčová slova anglicky

breast cancer; SELDI-TOF MS; cDNA clusters

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 1. 2. 2012 09:55, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Anotace

V originále

Microarray-based gene expression profiling represents a major breakthrough for understanding the molecular complexity of breast cancer. cDNA expression profiles cannot detect changes in activities that arise from posttranslational modifications, however, and therefore do not provide a complete picture of all biologically important changes that occur in tumors. Additional opportunities to identify and/or validate molecular signatures of breast carcinomas are provided by proteomic approaches. Surface-enhanced laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) offers high-throughput protein profiling, leading to extraction of protein array data, calling for effective and appropriate use of bioinformatics and statistical tools.

Česky

Genomové profilování na principu cDNA-microarrays reprezentuje základní nástroj pro pochopení molekulární komplexity rakoviny prsu. cDNA expresní profily nicméně nejsou schopny detekovat změny dané posttranslačními modifikacemi proteinů a neposkytují tedy komplexní obraz všech biologicky významných změn, které nastávají v nádorech. Nové možnosti identifikace a/nebo validace molekulárních změn u karcinomu prstu proto představují proteomické přístupy. Metoda SELDI-TOF MS umožňuje vysoce kapacitní proteinové profilování a poskytuje data "array" typu snadno analyzovatelná pomocí bioinformatických a statistických nástrojů.

Návaznosti

MZ0MOU2005, záměr
Název: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
NR8338, projekt VaV
Název: Funkční analýza drah regulovaných proteinem p53 u nádorů prsu: Integrace genomických a proteomických přístupů zahrnujících techniky DNA-macroarray a hmotnostní spektrometrii na principu SELDI-TOF