Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients

TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KOUTNÁ, Martin KLABUSAY, Viera HRABČÁKOVÁ and Petr KRONTORÁD. Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients. In 3rd ESF Functional Genomics Conference. 2008.

Basic information

• Original name: Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients
• Name in Czech: Profilování genové exprese během ex vivo granulopoézy jako možný nástroj na zhodnocení kvality CD34+ buněk od pacientů s lymfomem
• Authors: TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KOUTNÁ, Martin KLABUSAY, Viera HRABČÁKOVÁ and Petr KRONTORÁD.
• Edition: 3rd ESF Functional Genomics Conference, 2008.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Austria
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Organization unit: Faculty of Informatics
• Keywords in English: hematopoietic stem cells; non-Hodgkins lymphoma; cDNA microarray; CD34+ cells; ex vivo differentiation
• Tags: CD34+ cells, cDNA microarray, ex vivo differentiation, Hematopoietic stem cells, non-Hodgkins lymphoma
• Tags: International impact, Reviewed

Abstract

Expression profiles of peripheral blood CD34+ cells from a healthy donor and from a patient with NHL were compared by cDNA microarray technique during ex vivo granulocyte differentiation. It was found that standard differentiation expression profile of donor’s cells was different from the profile of NHL patient’s cells in terms of gene expression kinetics, counts of genes involved in granulopoiesis, and gene expression levels. The exact cause of found gene expression changes remains to be established. Ex vivo granulocyte differentiation of CD34+ cells is a well established method. Together with cDNA technology it may become a tool for evaluating physiological abnormalities within CD34+ cell population.

Abstract (in Czech)

Pomocí technologie cDNA microarrays byly srovnány expresní profily CD34+ buněk z periferní krve od zdravého dárce a pacienta s NHL a to během jejich ex vivo granulocytární diferenciace. Mezi sledovanými populacemi buněk byly nalezeny rozdíly v počtu a zastoupení genů zapojených do diferenciačních procesů a v kinetice exprese některých ze sledovaných genů během diferenciace. Otázkou zůstává, co je příčinou této rozdílné genové exprese. Navozená ex vivo granulocytární diferenciace CD34+ buněk je v klinické praxi již zavedenou metodou. Spolu s technologií cDNA microarrays a detailním profilováním genové exprese by se mohla stát nástrojem pro zhodnocení fyziologických abnormalit uvnitř populace CD34+ buněk.

Links

• MSM0021622430, plan (intention): Name: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Functional and molecular characteristics of cancer and normal stem cells - identification of targets for novel therapeutics and therapeutic strategies

• 2B06052, research and development project: Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images