a 2008

Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients

TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KOUTNÁ, Martin KLABUSAY, Viera HRABČÁKOVÁ, Petr KRONTORÁD et. al.

Basic information

Original name

Gene Expression Profiling During Ex Vivo Granulopoiesis: a Possible Tool for Quality Assessment of CD34+ Cells from Lymphoma Patients

Name in Czech

Profilování genové exprese během ex vivo granulopoézy jako možný nástroj na zhodnocení kvality CD34+ buněk od pacientů s lymfomem

Authors

TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KOUTNÁ, Martin KLABUSAY, Viera HRABČÁKOVÁ and Petr KRONTORÁD

Edition

3rd ESF Functional Genomics Conference, 2008

Other information

Language

English

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Austria

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Informatics

Keywords in English

hematopoietic stem cells; non-Hodgkins lymphoma; cDNA microarray; CD34+ cells; ex vivo differentiation

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 2/6/2010 11:40, Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D.

Abstract

V originále

Expression profiles of peripheral blood CD34+ cells from a healthy donor and from a patient with NHL were compared by cDNA microarray technique during ex vivo granulocyte differentiation. It was found that standard differentiation expression profile of donor’s cells was different from the profile of NHL patient’s cells in terms of gene expression kinetics, counts of genes involved in granulopoiesis, and gene expression levels. The exact cause of found gene expression changes remains to be established. Ex vivo granulocyte differentiation of CD34+ cells is a well established method. Together with cDNA technology it may become a tool for evaluating physiological abnormalities within CD34+ cell population.

In Czech

Pomocí technologie cDNA microarrays byly srovnány expresní profily CD34+ buněk z periferní krve od zdravého dárce a pacienta s NHL a to během jejich ex vivo granulocytární diferenciace. Mezi sledovanými populacemi buněk byly nalezeny rozdíly v počtu a zastoupení genů zapojených do diferenciačních procesů a v kinetice exprese některých ze sledovaných genů během diferenciace. Otázkou zůstává, co je příčinou této rozdílné genové exprese. Navozená ex vivo granulocytární diferenciace CD34+ buněk je v klinické praxi již zavedenou metodou. Spolu s technologií cDNA microarrays a detailním profilováním genové exprese by se mohla stát nástrojem pro zhodnocení fyziologických abnormalit uvnitř populace CD34+ buněk.

Links

MSM0021622430, plan (intention)
Name: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Functional and molecular characteristics of cancer and normal stem cells - identification of targets for novel therapeutics and therapeutic strategies
2B06052, research and development project
Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images