Identifikace a typizace stafylokoků metodou (GTG)5-PCR.

NOVÁKOVÁ, Dana. Identifikace a typizace stafylokoků metodou (GTG)5-PCR. (Identification and typing of staphylococci using (GTG)5-PCR.). In Mikrobiální identifikace 2008. 2008th ed. Brno: PLIVA-Lachema Diagnostica s.r.o., 2008, p. 13.

Basic information

• Original name: Identifikace a typizace stafylokoků metodou (GTG)5-PCR.
• Name (in English): Identification and typing of staphylococci using (GTG)5-PCR.
• Authors: NOVÁKOVÁ, Dana (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: 2008. vyd. Brno, Mikrobiální identifikace 2008, p. 13-13, 2008.
• Publisher: PLIVA-Lachema Diagnostica s.r.o.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/08:00027325
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: identification; typing; staphylococci; (GTG)5-PCR
• Tags: (GTG)5-PCR, identification, staphylococci, typing

Abstract

Infekční onemocnění způsobené stafylokoky představují jednu z nejzávažnějších oblastí dnešní lékařské mikrobiologie. Počet rezistentních kmenů klinicky významných druhů stafylokoků stoupá stejně jako výskyt nezvyklých koaguláza-negativních stafylokoků v materiálech pacientů. Klinický význam těchto stafylokoků nebyl doposud objasněn, zcela vyloučen však být nemůže. Rychlá a spolehlivá identifikace je klíčem k posouzení jakéhokoli nálezu bakterií v klinickém materiálu a především pak k účinné terapii. Celkem 123 kmenů náležících do všech 50 validně publikovaných druhů a poddruhů stafylokoků bylo analyzováno pomocí rep-PCR za využití (GTG)5 primeru. Převážná část testovaných taxonů (90%), včetně všech klinicky významných druhů, tvořila druhově specifické, dobře odlišitelné PCR profily. Poddruhy Staphylococcus hominis, S. schleiferi, S. cohnii a S. capitis vytvářely navíc i profily specifické poddruhově. Zástupci taxonů Staphylococcus intermedius, S. hyicus, S. kloosii, S. sciuri subsp. sciuri a S. carnosus subsp. utilis poskytovaly dvoje viditelně odlišné typy PCR profilů. U všech testovaných kultur byl zjištěn vizuálně jedinečný (GTG)5-PCR profil, typizace tedy potvrdila, že se jedná o rozdílné kmeny. Získané výsledky prokázaly velký potenciál metody jak pro identifikaci většiny stafylokoků, tak i pro kmenovou typizaci. Práce byla zpracována za podpory projektu MSM0021622416.

Abstract (in English)

(GTG)5-PCR fingerprinting proved to be suitable and reliable tool for identification and typing of wide range of staphylococcal species.

Links

• MSM0021622416, plan (intention): Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time