MANDÁKOVÁ, Terezie and Martin LYSÁK. Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae). Plant Cell. United States: AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2008, vol. 20, October, p. 2559-2570. ISSN 1040-4651.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae)
Name in Czech Evoluce karyotypu u vybraných druhů s počtem chromosomů n=7 z čeledi brukvovitých (Brassicaceae)
Authors MANDÁKOVÁ, Terezie (203 Czech Republic) and Martin LYSÁK (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Plant Cell, United States, AMER SOC PLANT BIOLOGISTS, 2008, 1040-4651.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher United States of America
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 9.296
RIV identification code RIV/00216224:14310/08:00024401
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000261378600009
Keywords in English Brassicaceae; comparative chromosome painting (CCP); karyotype evolution; chromosomal phylogeny
Tags Brassicaceae, chromosomal phylogeny, comparative chromosome painting (CCP), karyotype evolution
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574. Changed: 26/6/2009 10:56.
Abstract
Karyotype evolution in species with identical chromosome number but belonging to distinct phylogenetic clades is a longstanding question of plant biology, intractable by conventional cytogenetic techniques. Here, we apply comparative chromosome painting (CCP) to reconstruct karyotype evolution in eight species with x=7 (2n=14, 28) chromosomes from six Brassicaceae tribes. CCPdata allowed us to reconstruct an ancestral Proto-Calepineae Karyotype (PCK; n=7) shared by all x=7 species analyzed. The PCK has been preserved in the tribes Calepineae, Conringieae, and Noccaeeae, whereas karyotypes of Eutremeae, Isatideae, and Sisymbrieae are characterized by an additional translocation. The inferred chromosomal phylogeny provided compelling evidence for a monophyletic origin of the x=7 tribes. Moreover, chromosomal data along with previously published gene phylogenies strongly suggest the PCK to represent an ancestral karyotype of the tribe Brassiceae prior to its tribe-specific whole-genome triplication. As the PCK shares five chromosomes and conserved associations of genomic blocks with the putative Ancestral Crucifer Karyotype (n=8) of crucifer Lineage I, we propose that both karyotypes descended from a common ancestor. A tentative origin of the PCK via chromosome number reduction from n=8 to n=7 is outlined. Comparative chromosome maps of two important model species, Noccaea caerulescens and Thellungiella halophila, and complete karyotypes of two purported autotetraploid Calepineae species (2n=4x=28) were reconstructed by CCP.
Abstract (in Czech)
Na základě experimentálních dat získaných metodou komparativního chromosomálního paintingu (KCP) byl zrekonstruován ancestrální Proto-Calepineae Karyotyp (PCK; n=7), který pravděpodobně sdíleli předci analyzovaných druhů se sedmi páry chromosomů (x=7). PCK zůstal zachován u druhů v tribech Calepineae, Conringieae a Noccaeeae, zatímco v karyotypech druhů tribů Eutremeae, Isatideae a Sisymbrieae došlo k sekundárním translokacím. Naše data přesvědčivě dokládají monofyletický původ všech analyzovaných x=7 tribů. Chromosomální data společně s dříve publikovanými fylogenetickými studiemi, naznačují, že PCK představuje také ancestrální karyotyp tribu Brassiceae (druhy rodu Brassica a příbuzné rody). Protože PCK sdílí 5 chromosomů a unikátní asociace genomových bloků s předpokládaným ancestrálním. karyotypem (Ancestral Crucifer Karyotype, ACK; n=8) vývojové linie brukvovitých rostlin -Lineage I, lze předpokládat, že se oba tyto karyotypy vyvinuly ze společného předka.
Links
KJB601630606, research and development projectName: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
PrintDisplayed: 31/5/2024 13:51