a 2008

Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins

PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra a Jiří FAJKUS

Základní údaje

Originální název

Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins

Název česky

Vývoj specifických protilátek proti rostlinným telomer-vazebným proteinům.

Autoři

PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra (203 Česká republika, garant) a Jiří FAJKUS (203 Česká republika)

Vydání

Protein Expression Europe & Antibodies Europe, 2008

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/08:00025187

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova anglicky

antibody; AtTRB proteins; plant

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 9. 4. 2010 12:54, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.

Anotace

V originále

AtTRB (Telomeric Repeat Binding) proteins bind plant telomeric sequence (TTTAGGG)n via their Myb domain, similarly to human hTRF1 or hTRF2 (Telomeric Repeat Factor) which bind to human telomeric sequence (TTAGGG)n. In A. thaliana there are five AtTRB homologues. All AtTRBs contain Myb domain at the N-terminus, central H1/5-like domain and coiled-coil domain at the C-terminus. Even though they are similar at AA sequence they partly differ in their chemical properties or in expression levels in different plant compartments. To determine more precisely the binding sequence of AtTRB proteins and their intracellular localization in vivo we need to get specific antibodies for ChIP experiments. We have expressed the least similar peptide sequence of each AtTRB protein that is located in the loop between Myb domain and H1/5 domain in E. coli.

Česky

AtTRB proteiny se vážící se na telomerickou DNA skrz jeich Myb vazebnou doménu, stejně jako lidské hTRF1 a hTRF2. V A. thaliana bylo objeveno 5 homologů AtTRB proteinů. Všechny obsahují C-koncovou Myb doménu a centrální H1/5-like doménu. Vzhledem k vysoké podobnosti všech pěti proteinů bylo nutno při návrhu specifických protilátek vytipovat nejméně homologní oblast. Tato oblast lokalizovaná mezi Myb doménou a h1/5 doménou, byla naklonována do expresních vektorů a exprimována v bakteriálním expresním systému. Takto exprimovanými proteiny byly imunizovány myši, které vytváření monoklonální protilátky, specificky rozeznávající jednotlivé AtTRB proteiny.

Návaznosti

GP521/08/P452, projekt VaV
Název: Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny
Investor: Grantová agentura ČR, Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací