J 2009

Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosa Lectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis.

WIMMEROVÁ, Michaela, Navnit Kumar MISHRA, Martina POKORNÁ a Jaroslav KOČA

Základní údaje

Originální název

Importance of oligomerisation on Pseudomonas aeruginosa Lectin-II binding affinity. In silico and in vitro mutagenesis.

Název česky

Význam oligomerizace pro vazebnou afinitu lektinu PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa. In silico a in vitro mutageneze.

Autoři

WIMMEROVÁ, Michaela (203 Česká republika), Navnit Kumar MISHRA (356 Indie), Martina POKORNÁ (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant)

Vydání

Journal of Molecular Modeling, 2009, 1610-2940

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10610 Biophysics

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.336

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00034730

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000265441900014

Klíčová slova anglicky

protein-carbohydrate interaction; computational chemistry

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 24. 8. 2009 16:05, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.

Anotace

V originále

The effect of terminal GLY114* deletion on the binding affinity of the PA-IIL lectin towards L fucose was investigated. Both experimental (Isothermal Titration Calorimetry) and computational (Molecular dynamics simulations) methods have shown that the deletion mutation decreases the L fucose affinity. It implies that the PA-IIL saccharide binding affinity is influenced by the dimerization of the lectin. A detailed analysis of computational data confirms the key role of electrostatic interactions in the PA-IIL/saccharide binding.

Česky

Byl studován vliv terminální aminokyseliny Gly114 na oligomerizaci a vazebnou afinitu lektinu PA-IIL z Pseudomonas aeruginosa.

Návaznosti

LC06030, projekt VaV
Název: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
ME08008, projekt VaV
Název: Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik, Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím