2009
Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
BOUCHAL, Pavel, Theodoros ROUMELIOTIS, Roman HRSTKA, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK et. al.Základní údaje
Originální název
Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
Název česky
Vyhledávání biomarkerů karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomové analýzy s použitím značek se stabilními izotopy a dvourozměrné chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií (iTRAQ-2DLC-MS/MS)
Autoři
BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Theodoros ROUMELIOTIS (300 Řecko), Roman HRSTKA (203 Česká republika), Rudolf NENUTIL (203 Česká republika, domácí), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Česká republika) a Spiros D. GARBIS (300 Řecko)
Vydání
Journal of Proteome Research, Washington, USA, ACS, 2009, 1535-3893
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 5.132
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00029221
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000262171100037
Klíčová slova anglicky
Breast cancer; biomarkers; proteomics; mass spectrometry; liquid chromatography; iTRAQ
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 1. 2. 2012 09:52, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
The present pilot study constitutes a proof-of-principle in the use of a quantitative LC-MS/MS based proteomic method for the comparative analysis of representative low-grade breast primary tumor tissues with and without metastases and metastasis in lymph node relative to the nonmetastatic tumor type. The study method incorporated iTRAQ stable isotope labeling, two-dimensional liquid chromatography, nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid QqTOF platform (iTRAQ-2DLC-MS/MS). The principal aims of this study were (1) to define the protein spectrum obtainable using this approach, and (2) to highlight potential candidates for verification and validation studies focused on biomarkers involved in metastatic processes in breast cancer. The study resulted in the reproducible identification of 605 nonredundant proteins.
Česky
Prezentovaná studie představuje první využití metody proteomové analýzy na principu kombinace značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) pro srovnání proteinového složení dvou primárních nádorů prsu nízkého stupně malignity (metastazující a nemetastazující) a metastáze v lymfatické uzlině. Hlavními cíli studie bylo: (1) definovat proteinové spektrum detegovatelné touto metodou a (2) odhalit protenciální kandidátní biomarkery pro následné ověřovací a validační studie. Pomocí studie bylo detegováno 605 proteinů.
Návaznosti
| GP203/07/P471, projekt VaV |
| ||
| LC06035, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
|