Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.

FLASAROVÁ, Magdalena, Petra MATĚJKOVÁ, Zuzana VALIŠOVÁ, David ŠMAJS and Vladana WOZNICOVÁ. Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu. (Detection of Treponema pallidum in clinical material). In Celostátní sjezd mikrobiologie a epidemiologie, sborník abstrakt. 2008.

Basic information

• Original name: Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
• Name in Czech: Treponema pallidum ssp. pallidum a její detekce v klinickém materiálu.
• Name (in English): Detection of Treponema pallidum in clinical material
• Authors: FLASAROVÁ, Magdalena (203 Czech Republic), Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic), Zuzana VALIŠOVÁ (203 Czech Republic), David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor) and Vladana WOZNICOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Celostátní sjezd mikrobiologie a epidemiologie, sborník abstrakt, 2008.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/08:00025298
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords (in Czech): syfilis; Treponema pallidum ssp. pallidum; klinická diagnostika
• Keywords in English: syphilis; Treponema pallidum ssp. pallidum; clinical diagnostics
• Tags: clinical diagnostics, syphilis, Treponema pallidum ssp. pallidum

Abstract

Metodou nested PCR detekující gen tmpC a polA bylo celkem nalezeno 40 pozitivních vzorků od 27 pacientů včetně 2 novorozenců. Ze 73 vyšetřovaných stěrů bylo nalezeno 22 pozitivních stěrů od 16 pacientů a z 46 vzorků plné krve bylo pozitivních 16 od 15 pacientů. Z toho u 2 novorozenců s kongenitální syfilis byly nalezeny čtyři PCR pozitivní klinické vzorky. U jednoho dítěte byla prokázána PCR pozitivita u plné krve a u druhého byly zachyceny 3 pozitivní klinické izoláty ze séra, stěru a likvoru. U 22 z 40 pozitivních vzorků byla úspěšná typizace alespoň v 1 z lokusů TP136 nebo TP548 a bylo tak získáno 6 vzorků sekvenčně unikátních a 16 vzorků shodných s popsaným kmenem SS14. V případě typizování více vzorků od téhož pacienta byly nalezeny shodné výsledky.

Abstract (in English)

Nested PCR detecting tmpC and polA genes was employed to discover 40 PCR positive samples from 27 patients including 2 newborns. Out of total 73 lesion swabs, 22 was PCR positive (coming from 16 patients). Among 46 whole blood samples, 16 were PCR positive (from 15 patients). 4 samples were PCR positive in 2 newborns with congenital syphilis. One newborn was PCR positive in the sample of whole blood and the second one was PCR positive in serum, lesion swab and cerebrospinal fluid. In 22 out of 40 samples containing treponemal DNA, typing of at least one of two loci (TP0136 or TP0548) was succesful and 6 unique sequences were discovered. Remaining 16 samples showed sequences identical to SS14 strain. There was complete concordance of multiple samples collected from the same patient where applicable.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR