Hardware Acceleration of Approximate Palindromes Searching

MARTÍNEK, Tomáš and Matej LEXA. Hardware Acceleration of Approximate Palindromes Searching. In The International Conference on Field-Programmable Technology. Taipei: IEEE Computer Society, 2008, p. 65-72. ISBN 978-1-4244-2796-3.

Basic information

Original name

Hardware Acceleration of Approximate Palindromes Searching

Name in Czech

Hardwarová akcelerace hledání přibližných palindromů

Authors

MARTÍNEK, Tomáš (203 Czech Republic) and Matej LEXA (703 Slovakia, guarantor)

Edition

Taipei, The International Conference on Field-Programmable Technology, p. 65-72, 8 pp. 2008

Publisher

IEEE Computer Society

---

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

20206 Computer hardware and architecture

Country of publisher

Taiwan

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14330/08:00025313

Organization unit

Faculty of Informatics

ISBN

978-1-4244-2796-3

UT WoS

000263224000009

Keywords in English

FPGA; approximate palindrome

Tags

approximate palindrome, FPGA

---

Abstract

V originále

We present FPGA-based hardware architecture for approximate palindrome searching

In Czech

Prezentujeme hardwarovou platformu založenou na FPGA čipech pro vyhledávání přibližných palindromů v biologických sekvencích

---

Links

GA204/08/1560, research and development project

Name: Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA Investor: Czech Science Foundation, In vitro and in silico identification of non-canonical DNA structures in genomic sequences