Mutational Screening of SCN5A in Patients Suspected of LQTS

RAUDENSKÁ, Martina, Tomáš NOVOTNÝ, Alexandra BITTNEROVÁ a Anna VAŠKŮ. Mutational Screening of SCN5A in Patients Suspected of LQTS. In European Journal of Heart Failure Supplements 2009; Vol. 8(2). 2009.

Základní údaje

• Originální název: Mutational Screening of SCN5A in Patients Suspected of LQTS
• Název česky: Mutační screening genu SCN5A u pacientů podezřelých z LQTS
• Autoři: RAUDENSKÁ, Martina, Tomáš NOVOTNÝ, Alexandra BITTNEROVÁ a Anna VAŠKŮ.
• Vydání: European Journal of Heart Failure Supplements 2009; Vol. 8(2), 2009.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova česky: SCN5A; syndrom prodlouženého QT intervalu;mutační screening
• Klíčová slova anglicky: SCN5A; Long QT Syndrome; Mutational Screening
• Štítky: long QT syndrome, Mutational Screening, SCN5A

Anotace

Purpose: Long QT syndrome (LQTS), an inherited cardiac arrhythmia, is a disorder of ventricular repolarisation characterised by electrocardiographic abnormalities and the onset of torsades de pointes leading to syncope and sudden death. Genetic polymorphisms in cardiac ion channel genes have been identified to be responsible for the disorder. The aim of this study was to screen disease-causing mutations and associated polymorphisms in the SCN5A gene. We collected 37 LQTS suspected patients who had no mutations in main LQTS genes and 37 age and sex matching healthy controls. Methods: The coding region of the SCN5A gene was systematically screened for mutations using PCR, SSCP and sequencing analysis. Results: The mutational analysis of the SCN5A revealed 3 synonymous (G87A, G3183A, D1819D), 1 non-synonymous (H558R) and 3 intronic polymorphisms (IVS24+53TC, IVS25+65GA, IVS9-3CA). The IVS25+65GA variant was detected only in the control group and was described in czech population for the first time. Conclusions: The IVS9-3CA polymorphism is probably associated with acceptor splice site mutation. We disclosed coexistence between polymorphisms IVS9-3C A and A1673G (H558R) in our patiens and controls.

Anotace česky

Syndrom prodlouženého QT intervalu (LQTS) je dědičné srdeční onemocnění charakterizované poruchami ventrikulární depolarizace, EKG abnormalitami a torsades de pointes, které vedou k synkopám a náhlé srdeční smrti. Již dříve bylo zjištěno, že s tímto onemocněním jsou spojeny změny na úrovni DNA v genech pro srdeční iontové kanály. Cílem naší studie byl screening genetických variant genu SCN5A. Podařilo se nám analyzovat 37 LQTS suspektních pacientů, kteří neměli mutaci v žádném z hlavních kandidátních genů LQTS a 37 zdravých kontrol, kteří věkem a pohlavím odpovídaly našim pacientům. Metody: Pro mutační screening jsme využili metody PCR, SSCP a automatické sekvencování. Výsledky: V genu SCN5A jsme nalezli 3 synonymní polymorfismy (G87A, G3183A, D1819D), 1 nesynonymní polymorfismus A1673G (H558R) a 3 polymorfismy intronové (IVS24+53TC, IVS25+65GA, IVS9-3CA). Varianta IVS25+65GA byla nalezena pouze u kontrolní skupiny. Jedná se o dosud nepopsaný polymorfismus. Varianta IVS9-3CA pravděpodobně působí změnu akceptorového střihového místa. Odhalili jsme též koexistenci polymorfismů IVS9-3CA a A1673G (H558R) a to u pacientů i kontrolní skupiny.

Návaznosti

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací