A combined AFLP-multiplex PCR assay for molecular typing of Escherichia coli strains using variable bacterial interspersed mosaic elements

HORVÁTH, Radek, Miloš DENDIS, J. SCHLEGELOVA, Filip RŮŽIČKA a J. BENEDÍK. A combined AFLP-multiplex PCR assay for molecular typing of Escherichia coli strains using variable bacterial interspersed mosaic elements. Epidemiology and Infection. Cambridge: Cambridge University Press, 2004, roč. 132, č. 1, s. 61-65, 2 s. ISSN 0950-2688.

Základní údaje

Originální název

A combined AFLP-multiplex PCR assay for molecular typing of Escherichia coli strains using variable bacterial interspersed mosaic elements

Název česky

Kombinovaná AFLP-multiplex PCR assay pro molekulární typizaci kmenů Escherichia coli

Autoři

HORVÁTH, Radek (203 Česká republika, garant), Miloš DENDIS (203 Česká republika), J. SCHLEGELOVA (203 Česká republika), Filip RŮŽIČKA (203 Česká republika) a J. BENEDÍK (203 Česká republika)

Vydání

Epidemiology and Infection, Cambridge, Cambridge University Press, 2004, 0950-2688

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Velká Británie a Severní Irsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 1.636

Kód RIV

RIV/00216224:14110/04:00035770

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

UT WoS

000220290200010

Klíčová slova anglicky

AFLP-multiplex PCR; molecular typing; Escherichia coli

Štítky

AFLP-multiplex PCR, Escherichia coli, molecular typing

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno

---

Anotace

V originále

The original method for molecular typing of E. coli strains was developed using the polymorphism in chromosomal sequences of bacterial interspersed mosaic elements (BIMEs) detected by Multiplex PCR and analysed by AFLP assay. The applicability of the method in the epidemiology of E. coli was tested on a group of 524 strains of human and veterinary origin. In the studied group 18 different genotypes were detected. Significant differences were found in the frequencies of the genotypes among various groups of strains, suggesting the method could be a promising tool in the epidemiology of E. coli.

Česky

Tato nová metoda pro molekulární typizaci kmenů E. coli byla vyvinuta na základě polymorfizmu v chromozomálních sekvencích bakteriálních interspersed mosaic elements (BIMEs) detekovaných pomocí Multiplex PCR a AFLP. Využití metody v praxi bylo ověřeno na skupině 524 kmenů humánního i veterinárního původu. V této skupině bylo zjištěno 18 různých genotypů. Mezi jednotlivými genotypy byly zjištěny významné rozdíly ve frekvenci jejich výskytu u jednotlivých skupin. To ukazuje, že metoda může být slibným nástrojem v epidemiologických analýzách E. coli.