J 2006

Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy

TICHÝ, Boris, M. SVOBODA, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ

Základní údaje

Originální název

Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy

Název anglicky

Sample taking and processing for expression DNA microarrays

Autoři

TICHÝ, Boris (203 Česká republika, garant), M. SVOBODA (203 Česká republika), Jiří MAYER (203 Česká republika) a Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika)

Vydání

Klinická onkologie, 2006, 1802-5307

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

30200 3.2 Clinical medicine

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/06:00028311

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

RNA; DNA čip; biopsie; genová exprese

Klíčová slova anglicky

RNA; microarray; biopsy; gene expression

Příznaky

Recenzováno
Změněno: 26. 7. 2010 13:49, RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D.

Anotace

V originále

Moderní metodiky studia genové exprese na úrovni RNA využívající DNA čipy (DNA microarrays) představují účinný nástroj nejen pro výzkum onkologických onemocnění, ale mají i velký potenciál stát se základem nových diagnostických postupů. Jejich úspěšná aplikace však vyžaduje zvládnutí problematických postupů jako jsou odběr vzorku, izolace RNA nebo značení nukleových kyselin. S ohledem na množství různých DNA čipových platforem, neexistuje jeden univerzální návod, který by mohl být použit ve všech laboratořích. Protokoly zpracování DNA čipů se proto, nikdy velmi výrazně liší, což má negativní dopad i na možnost jejich diagnostického využití.

Anglicky

Gene expression profiling using DNA microarrays represents not only a powerfull tool for oncological research but have also a big potential to become a standard diagnostic technique. However, successfull microarray application needs to overcome some pitfalls such as sample collection, RNA isolation or nucleic acid labeling. Due to the number of microarray platforms there is no universal guide that can be used by all laboratories. The number of sometimes very different protocols for DNA microarray processing has a negative impact on their diagnostic utilization.

Návaznosti

NR8448, projekt VaV
Název: Charakterizace genové exprese leukemických buněk pomocí DNA čipů a její využití pro molekulární diagnostiku a predikci odpovědi na léčbu