2009
Application of fluorescence anisotropy to monitor protein binding to telomeric DNA
ZIMMERMANN, Michal, Ctirad HOFR, Pavla ŠULTESOVÁ, Iva MOZGOVÁ, Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ et. al.Základní údaje
Originální název
Application of fluorescence anisotropy to monitor protein binding to telomeric DNA
Název česky
Sledování vazby proteinů a telomerické DNA pomocí měření anizotropie fluorescence
Autoři
ZIMMERMANN, Michal (203 Česká republika), Ctirad HOFR (203 Česká republika), Pavla ŠULTESOVÁ (203 Česká republika), Iva MOZGOVÁ (203 Česká republika), Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ (203 Česká republika) a Jiří FAJKUS (203 Česká republika, garant)
Vydání
FluoroFest Prague 2009, 2009
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Konferenční abstrakt
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00029388
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky
Protein-DNA interaction; Arabidopsis thaliana; SMH protein; fluorescence anisotropy; electrophoretic mobility shift assay
Štítky
Změněno: 9. 4. 2010 12:35, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
V originále
Using fluorescence anisotropy, we were able to compare the affinity of AtTRB proteins to fluorescently labeled DNA fragments harboring specific and nonspecific sequences and also to determine the optimal binding site by varying the size of the DNA fragments. Moreover, because fluorescence anisotropy enables the measurements to be performed in variety of experimental conditions, we managed to measure how the affinity depends on ionic strength. This allowed us to determine the electrostatic and nonelectrostatic contributions to the overall binding affinity of proteins to telomeric DNA. Based on these findings, a putative functional model of the complex between AtTRB proteins and telomeric DNA was constructed.
Česky
Technikou měření anizotropie fluorescence byla určena afinita AtTRB proteinů k fluorescenčně značené DNA nesoucí specifické a nespecifické sekvence a zároveň byla zjištěna délka optimálního vazebného místa pro tyto proteiny. Protože anizotropie fluorescence umožňuje provádět experimenty v celé řadě podmínek, byla změřena závislost afinity na iontové síle. To umožnilo stanovit podíl elektrostatických a neelektrostatických sil na celkové afinitě. Na základě získaných výsledků byl nově navržen možný funkční model vytváření komplexu proteinů AtTRB a telomerové DNA.
Návaznosti
| GD204/08/H054, projekt VaV |
| ||
| GP521/08/P452, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622415, záměr |
|