Purine derivates - separation and characterization by selected methods

KRISTOVÁ, Petra, Blanka HÉGROVÁ, Marta FARKOVÁ, Jan PREISLER, Přemysl LUBAL and Libuše TRNKOVÁ. Purine derivates - separation and characterization by selected methods. In IX. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků. 2009th ed. Brno: MZLU, Brno, 2009, p. 49-50. ISBN 978-80-7375-309-2.

Basic information

• Original name: Purine derivates - separation and characterization by selected methods
• Name in Czech: Purinové deriváty - separace a charakterizace vybranými metodami
• Authors: KRISTOVÁ, Petra (203 Czech Republic, belonging to the institution), Blanka HÉGROVÁ (203 Czech Republic), Marta FARKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan PREISLER (203 Czech Republic, belonging to the institution), Přemysl LUBAL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Libuše TRNKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution).
• Edition: 2009. vyd. Brno, IX. Pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků, p. 49-50, 2 pp. 2009.
• Publisher: MZLU, Brno

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: 10406 Analytical chemistry
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• Publication form: printed version "print"
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/09:00036147
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 978-80-7375-309-2
• Keywords (in Czech): purinové báze - HPLC - pKa hodnoty
• Keywords in English: purine bases - HPLC - pKa values

Abstract

Purine bases represent the basic constituents of DNA, their analysis is useful in the diagnosis of several diseases and metabolite disorders. The related bases, such as 6-aminopurine (6-AP, 2-aminopurine (2-AP) and 2,6-diaminopurine (2,6-DAP) were studies by spectroscopic and RP-HPLC techniques. Studied APs can be separated based on their spectral properties. Elution order related to polarity of molecule, in MF MetOH/30mM phosphate buffer (15:85), was following: 2,6-DAP, 2-AP, 6-AP. The phosphate concentration is not crucial. Experimental pKa values of model APs were calculated from corrected capacity factor dependence of APs on pH. The basicity increasing in order 2-AP<6-AP<2,6-DAP. Studies of basic structures will be used for nucleosides and nucleotides study, where 2-AP and 2,6-DAP can be used as fluorescent labels.

Abstract (in Czech)

Purinové báze představují základní prvek DNA, jejich analýza je nezbytná pro diagnózu jednotlivých nemocí a metabolických poruch. Báze jako jsou 6-aminopurin (6-AP), 2-aminopurin (2-AP) a 2,6-diaminopurin (2,6-DAP) byly zkoumány pomocí spektroskopických a RP-HPLC technik. APs mohou být separovány na základě jejich spektrálních vlastností. Eluční pořadí příslušné polaritě molekuly, v MF MetOH/30mM fosfátový pufr (15:85), bylo následující: 2,6-DAP, 2-AP, 6-AP. Koncentrace fosfátového pufru není pro separaci rozhodující. Na základě závislosti kapacitního faktoru APs na pH byly vypočteny experimentální pKa hodnoty jednotlivých APs. Bazicita APs roste v pořadí 2-AP<6-AP<2,6-DAP. Studie základních struktur bude použita pro následný výzkum nukleosidů a nukleotidů, kde 2-AP a 2,6-DAP mohou být použity jako fluorescenční značky.

Links

• LC06035, research and development project: Name: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine