a 2009

Prediction of localization and interactions of apoptotic proteins

VAŘECHA, Miroslav, Vladimír ULMAN, Pavel MATULA a Michal KOZUBEK

Základní údaje

Originální název

Prediction of localization and interactions of apoptotic proteins

Název česky

Predikce lokalizace a interakcí apoptotických proteinů

Autoři

VAŘECHA, Miroslav (203 Česká republika, garant), Vladimír ULMAN (203 Česká republika), Pavel MATULA (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika)

Vydání

Analytical Cytometry V, 2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14330/09:00037415

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

ISBN

978-80-254-2561-9

UT WoS

000268893400002

Klíčová slova česky

predikce lokalizace;AIF;endonukleáza G;AMID;fluorescenční mikroskopie;docking;modelování struktury proteinů

Klíčová slova anglicky

localization prediction;AIF;endonuclease G;AMID;fluorescence microscopy;docking;protein structure modeling

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 2. 6. 2010 11:48, Mgr. Miroslav Vařecha, Ph.D.

Anotace

V originále

We found the AMID protein to be cytoplasmic, most probably incorporated into the cytoplasmic side of the lipid membranes. Bioinformatic predictions were conducted to analyze the interactions of the studied proteins with each other and with other possible partners. We conducted molecular modeling of proteins with unknown 3D structures. These models were then refined by MolProbity server and employed in molecular docking simulations of interactions. Our results show data acquired using a combination of modern in silico methods and image analysis to understand the localization, interactions and functions of proteins AMID, AIF, endonuclease G, and other apoptosis-related proteins.

Česky

Predikce lokalizace a interakcí apoptotických proteinů

Návaznosti

LC535, projekt VaV
Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
2B06052, projekt VaV
Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů