2009
Spectroscopic study of protonation of oligonucleotides containing adenine and cytosine
VOJTYLOVÁ, Terézia, Dana DOSPIVOVÁ, Olga TŘÍSKOVÁ, Iveta PILAŘOVÁ, Přemysl LUBAL et. al.Základní údaje
Originální název
Spectroscopic study of protonation of oligonucleotides containing adenine and cytosine
Název česky
Spectroskopické studium protonace oligonukleotidů obsahujících adenin a cytosin
Autoři
VOJTYLOVÁ, Terézia (703 Slovensko), Dana DOSPIVOVÁ (203 Česká republika), Olga TŘÍSKOVÁ (203 Česká republika), Iveta PILAŘOVÁ (203 Česká republika), Přemysl LUBAL (203 Česká republika, garant), Marta FARKOVÁ (203 Česká republika), Libuše TRNKOVÁ (203 Česká republika) a Petr TÁBORSKÝ (203 Česká republika)
Vydání
Chem. Papers, 2009, 0366-6352
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele
Slovensko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 0.791
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00037430
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000270647700016
Klíčová slova česky
oligonukleotidy; adenin; cytosin; protonace; termodynamika; chemometrie
Klíčová slova anglicky
oligonucleotides; adenine; cytosine; protonation; thermodynamics; chemometrics
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 8. 4. 2010 18:51, prof. RNDr. Přemysl Lubal, Ph.D.
V originále
Acidobasic properties of purine and pyrimidine bases (adenine, cytosine) and relevant nucleosides (adenosine, cytidine) were studied by means of glass-electrode potentiometry and the respective dissociation constants were determined under given experimental conditions (I = 0.1 M (NaCl), t = (25.0 +/- 0.1) degrees of Celsius): adenine (pK_HL = 9.65 +/- 0.04, pK_H2L = 4.18 +/- 0.04), adenosine (pK_H2L = 3.59 +/- 0.05), cytosine (pK_H2L = 4.56 +/- 0.01), cytidine (pK_H2L = 4.16 +/- 0.02). In addition, thermodynamic parameters for bases were calculated. Acidobasic behavior of oligonucleotides ((CAC)3, A3C6, C3A3C3) was studied under the same experimental conditions by molecular absorption spectroscopy. pH-dependent spectral datasets were analyzed by means of advanced chemometric techniques (EFA, MCR-ALS) and the presence of hemiprotonated species concerning (C-C+) a non-canonical pair (i-motif) in titled oligonucleotides was proposed in order to explain experimental data obtained according to literature.
Česky
Acidobazické vlastnosti purinových a pyrimidinových bazí (adenin, cytosin) a příbuzných nukleosidů (adenosin, cytidin) byly studovány potenciometricky a následující disociační konstanty byly nalezeny (I = 0.1 M (NaCl), t = (25.0 +/- 0.1) st. C): adenin (pK_HL = 9.65 +/- 0.04, pK_H2L = 4.18 +/- 0.04), adenosin (pK_H2L = 3.59 +/- 0.05), cytosin (pK_H2L = 4.56 +/- 0.01), cytidin (pK_H2L = 4.16 +/- 0.02). Navíc také termodynamické parametry pro báze byly vypočteny. Acidobazické chování oligonukleotidů ((CAC)3, A3C6, C3A3C3) bylo studováno za stejných experimentálních podmínek pomocí molekulové absorpční spektroskopie. Spektrální data jako funkce pH byly analyzovány pomocí pokročilých chemometrických technik (EFA, MCR-ALS) a přítomnost částice obsahující (C-C+) nekanonický pár (i-motiv) v uvedených oligonukleotidech byl navržen, aby bylo možné vysvětlit experimentální data ve shodě s údaji uvedenými v literatuře.
Návaznosti
| LC06035, projekt VaV |
|