ADAM, Jan, Zdeněk KŘÍŽ, Martin PROKOP, Thomais CHATZIPAVLOU, Petros ZOTOS, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ. CRACKING THE LECTIN CODE ; IN SILICO MODELING AND STRUCTURE-FUNCTIONAL STUDY OF PRINCIPLES DRIVING SUGAR PREFERENCE IN PAIIL FAMILY. In FEBS Journal. Oxford: Wiley-Blackwell, 2009, s. 12-13. ISSN 1742-464X.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název CRACKING THE LECTIN CODE ; IN SILICO MODELING AND STRUCTURE-FUNCTIONAL STUDY OF PRINCIPLES DRIVING SUGAR PREFERENCE IN PAIIL FAMILY
Název česky CRACKING THE LECTIN CODE ; IN SILICO MODELING AND STRUCTURE-FUNCTIONAL STUDY OF PRINCIPLES DRIVING SUGAR PREFERENCE IN PAIIL FAMILY
Autoři ADAM, Jan, Zdeněk KŘÍŽ, Martin PROKOP, Thomais CHATZIPAVLOU, Petros ZOTOS, Jaroslav KOČA a Michaela WIMMEROVÁ.
Vydání Oxford, FEBS Journal, od s. 12-13, 2 s. 2009.
Nakladatel Wiley-Blackwell
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.042
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISSN 1742-464X
UT WoS 000267069900032
Klíčová slova česky lectin engineering; molecular modeling; thermodynamics
Klíčová slova anglicky lectin engineering; molecular modeling; thermodynamics
Štítky in silico mutagenesis, in silico prediction, microcalorimetry, molecular modeling
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc., učo 610. Změněno: 29. 4. 2011 15:39.
Anotace
INTRODUCTION Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic human pathogen, a bacterium capable of attacking individuals with lowered immunity barriers. It is e.g. responsible for lethal complications in patients with cystic fibrosis. The PAIIL lectin (a C type fucose-preferring lectin with sugar binding mediated by two calcium ions), produced by the bacterium plays a crucial role in the host pathogen interaction. Similar lectin sequences were found in other bacteria, displaying distinct differences in preference despite only small differences in structure of binding site. In vitro and in silico mutants were constructed in order to analyze the principles driving the sugar preference. METHODS Molecular docking was performed using the AUTODOCK and DOCK software.
Anotace česky
Molekulove modelovani muze vyrazne napomoci v modelovani biomolekularnich interakci, zde napriklad lektin-sacharidove interakce podilejici se na patogenicite bakterie Pseudomonas aeruginosa, jakoz i slouzit coby efektivni prostredek predpovidani chovani systemu v zavislosti na provedenych mutacich, usnadnujic tak experimentatorum cestu k porozumeni dane interakce a zpusobu, jak ji ovlivnovat cilenym smerem.
Návaznosti
LC06030, projekt VaVNázev: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 20. 7. 2024 00:27