2010
Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
KAMAL, Sharaf, Lucie HOROVÁ, Tomáš PAVLÍČEK, Nevo EVIATAR, Petr BUREŠ et. al.Základní údaje
Originální název
Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
Název česky
Velikost genomu a genomický poměr bází u Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae): rozdíly mezi přírodními a skladištními populacemi v Izraeli
Autoři
KAMAL, Sharaf (376 Izrael), Lucie HOROVÁ (203 Česká republika, domácí), Tomáš PAVLÍČEK (376 Izrael), Nevo EVIATAR (376 Izrael) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, garant, domácí)
Vydání
Journal of Stored Products Research, Amsterdam, New York, Elsevier, 2010, 0022-474X
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Nizozemské království
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Odkazy
Impakt faktor
Impact factor: 1.438
Kód RIV
RIV/00216224:14310/10:00043493
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000276115400006
Klíčová slova česky
velikost genomu; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Klíčová slova anglicky
Genome size; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 29. 4. 2013 12:08, prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.
V originále
In this study, flow cytometry was used for assessing and comparing the genome size (GS) and the whole genome base composition (AT/GC ratio) of the saw toothed grain beetle Oryzaephilus surinamensis (L.). In addition, the presence and frequency of endosymbiotic Wolbachia bacteria was studied. The haploid GS was estimated to lie within the range from 151.5 to 154 Mbp in O. surinamensis, making it the smallest value of haploid GS known among beetles. Furthermore, it was found that in eight silo pest populations GS was significantly smaller than in eight feral (native) populations obtained from fallen oak acorns. The ability of O. surinamensis to colonize different habitats globally could be connected with an unusually ATrich (for an invertebrate) genome (ATbase content ranging from 68 to 76%). Native (feral) populations of O. surinamensis appear to have genetically diverged from the storage-pest populations tested.
Česky
Průtoková cytometrie byla použita pro stanovení a srovnání velikosti genomu a genomové složení bazí (poměr AT/GC) u skladištního brouka Oryzaephilus surinamensis (L.). V trávicím traktu tohoto brouka byla dále studována přítomnost endosymbiotické bakterie Wolbachia. Srovnáním s interními standardami s odpovídající velikostí genomu stanovenou sekvenováním (Oryza sativa subsp. japonica Nipponbare, Arabidopsis thaliana Columbia, samičí linie Drosophila melanogaster) byla haploidní velikost genomu stanovena v rozmezí od 151.5 do 154 Mbp u studovaného O. surinamensis. Tato velikost je dosud nejmenší známou velikostí u brouků (Coleoptera). U osmi skladištních populací byla velikost genomu signifikantně menší než u osmi přirozených populací živících se dubovými žaludy. Schopnost O. surinamensis kolonizovat různé habitaty může být spojena s neobvykle AT bohatým (ve srovnání s jinými bezobratlými) genomem (obsah AT-bazí kolísá od 68 do 76%). Přirozané (ferální) populace O. surinamensis jsou více geneticky diverzifikované než populace skladištní.
Návaznosti
| LC06073, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622416, záměr |
|