2009
Studium protein-proteinových interakcí in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
HORÁK, Jakub, Vendula HRDINOVÁ a Jan HEJÁTKOZákladní údaje
Originální název
Studium protein-proteinových interakcí in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Název česky
Studium protein-proteinových interakcí in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Název anglicky
Studying protein-protein interactions in vivo: Y2H, BiFC, MeRA
Autoři
HORÁK, Jakub (203 Česká republika, garant), Vendula HRDINOVÁ (203 Česká republika) a Jan HEJÁTKO (203 Česká republika)
Vydání
5. Metodické dny, 2009
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Vyžádané přednášky
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV
RIV/00216224:14310/09:00039686
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky
protein-proteinové interakce; kvasinkový dvouhybridní systém; bimolekulární fluorescenční komplementace; zprostředkovaná vazba na membránu; interakce in vivo; Arabidopsis
Klíčová slova anglicky
protein-protein interaction; yeast two-hybrid; BiFC; bimolecular fluorescence complementatnion; MeRA; membrane recruitment assay; interactio in vivo; Arabidopsis
Změněno: 26. 3. 2010 16:01, Mgr. Jakub Horák, Dr. rer. nat.
V originále
Schopnost interagovat s dalšími proteiny je jednou ze základních charakteristik proteinů. K rychlému vyhledání interakčních partnerů rostlinných proteinů používáme několik metod pro in vivo analýzu proteinových interakcí v kvasinkách, nebo v transientně transoformovaných listech tabáku Nicotiana benthamiana. Kvasinkový dvouhybridní systém (Yeast two-hybrid system, Y2H) je klasickou metodou pro analýzu proteinových interakcí a je vhodné jej použít pro získání prvních interakčních informací. Výsledky je proto nutné ověřit jinými nezávislými metodami. Jednou z takových metod je bimolekulární fluorescenční komplementace (Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC). Další metodou vhodnou pro analýzu interakcí mezi membránovým proteinem a cytosolikcými proteiny zprostředkované vazby na membránu (Membrane Recruitment Assay, MeRA). Pro konstrukci rekombinantní DNA používáme ve všech třech popsaných případech klonování prostřednictvím Gateway technologie.
Anglicky
One of the fundamental characteristic of protein is the ability to interact with other proteins. Several methods are used to find interaction partners of proteins and study protein-protein interactions in vivo, e.g. in yeast or transiently transformed Nicotiana benthamiana leaves. Yeast two-hybrid assay is classical method used to obtain first information about protein interaction partners. However, it is necessary to verify yeast results by independent methods like bimolecular fluorescence complementation (BiFC) in tobacco leaves. Another method with similar experimental setup is membrane recruitment assay, which is used for studyin interactions between membrane and cytosolic protein. To construct recombinant DNA for all in vivo interaction methods, Gateway technology is used for cloning.
Návaznosti
| LC06034, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622415, záměr |
|