S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar
couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments

J 2010

S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments

NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ et. al.

Základní údaje

Originální název

S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments

Autoři

NOVÁK, Petr (203 Česká republika, domácí), Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, garant, domácí), Veronika MOTÁČKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Petr PADRTA (203 Česká republika, domácí), Alžbeta ŠVENKOVÁ (703 Slovensko), Jean Marc NUZILLARD (250 Francie), Libor KRÁSNÝ (203 Česká republika) a Vladimír SKLENÁŘ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Journal of Biomolecular NMR, Dordrecht, Springer Netherlands, 2010, 0925-2738

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Impakt faktor

Impact factor: 3.047

Kód RIV

RIV/00216224:14310/10:00043623

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000274088200006

Klíčová slova anglicky

Software - Sparky - Residual dipolar couplings - NMR

Změněno: 2. 5. 2012 16:12, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Anotace

V originále

S3EPY is a Python extension to the program Sparky written to facilitate the assessment of coupling constants from in-phase/antiphase and spin-state-selective excitation (S3E) experiments. It enables the routine use of small scalar couplings by automating the coupling evaluation procedure. S3EPY provides an integrated graphical user interface to programs which outputs graphs and the table of determined couplings.

Návaznosti

GA204/09/0583, projekt VaV

Název: Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií (Akronym: DELTA)

Investor: Grantová agentura ČR, Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií

LC06030, projekt VaV

Název: Biomolekulární centrum

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum

MSM0021622413, záměr

Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Citovat

NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. Journal of Biomolecular NMR. Dordrecht: Springer Netherlands, 2010, roč. 46, č. 2, s. 191-197. ISSN 0925-2738.

@article{878347,
   author = {Novák, Petr and Žídek, Lukáš and Motáčková, Veronika and Padrta, Petr and Švenková, Alžbeta and Nuzillard, Jean Marc and Krásný, Libor and Sklenář, Vladimír},
   article_location = {Dordrecht},
   article_number = {2},
   keywords = {Software - Sparky - Residual dipolar couplings - NMR},
   language = {eng},
   issn = {0925-2738},
   journal = {Journal of Biomolecular NMR},
   title = {S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments},
   url = {http://dx.doi.org/10.1007/s10858-009-9392-1},
   volume = {46},
   year = {2010}
}

TY  - JOUR
ID  - 878347
AU  - Novák, Petr - Žídek, Lukáš - Motáčková, Veronika - Padrta, Petr - Švenková, Alžbeta - Nuzillard, Jean Marc - Krásný, Libor - Sklenář, Vladimír
PY  - 2010
TI  - S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments
JF  - Journal of Biomolecular NMR
VL  - 46
IS  - 2
SP  - 191-197
EP  - 191-197
PB  - Springer Netherlands
SN  - 09252738
KW  - Software - Sparky - Residual dipolar couplings - NMR
UR  - http://dx.doi.org/10.1007/s10858-009-9392-1
N2  - S3EPY is a Python extension to the program Sparky written to facilitate the assessment of coupling constants from in-phase/antiphase and spin-state-selective excitation (S3E) experiments. It enables the routine use of small scalar couplings by automating the coupling evaluation procedure. S3EPY provides an integrated graphical user interface to programs which outputs graphs and the table of determined couplings.
ER  -

NOVÁK, Petr, Lukáš ŽÍDEK, Veronika MOTÁČKOVÁ, Petr PADRTA, Alžbeta ŠVENKOVÁ, Jean Marc NUZILLARD, Libor KRÁSNÝ a Vladimír SKLENÁŘ. S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments. \textit{Journal of Biomolecular NMR}. Dordrecht: Springer Netherlands, 2010, roč.~46, č.~2, s.~191-197. ISSN~0925-2738.

Podrobný výpis o publikaci