a 2009

Crystal structure of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana

KLUMPLER, Tomáš, Blanka PEKÁROVÁ, Jaromír MAREK, Pavla BORKOVCOVÁ, Lubomír JANDA et. al.

Základní údaje

Originální název

Crystal structure of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana

Autoři

KLUMPLER, Tomáš (203 Česká republika, garant), Blanka PEKÁROVÁ (203 Česká republika), Jaromír MAREK (203 Česká republika), Pavla BORKOVCOVÁ (203 Česká republika), Lubomír JANDA (203 Česká republika) a Jan HEJÁTKO (203 Česká republika)

Vydání

Kolokvium - Struktura 2009, 2009

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/09:00039824

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISSN

Klíčová slova anglicky

histidinkinase CKI1 Arabidopsis cytokinin signaling crystal structure
Změněno: 31. 3. 2010 10:51, Mgr. Tomáš Klumpler, Ph.D.

Anotace

V originále

The crystal structure of the receiver domain (RD) of the histidine kinase CYTOKININ-INDEPENDENT1 (CKI1) from Arabidopsis thaliana has been determined at a resolution of 2.0 Angstroem. Crystals of the recombinant RD of CKI1 have been obtained. The crystals diffracted at beamline BW7B of the DORIS-III storage ring to approx. 2.4 Angstroem.The crystals belong to space group C2221 with unit-cell parameters a=54.46, b=99.82, c=79.94 Angstroem, the asymmetric unit contains one molecule of the protein. The structure of CKI1RD had been solved by a molecular-replacement. Initial R value of 0.54, which decreased to R = 0.413 and Rfree = 0.426 after 30 cycles of REFMAC refinement. The three-dimensional structure of A. thaliana CKI1RD shows the conformational conservation of receiver proteins, such as CheY, CheB, ETRRD. CKI1RD is a single domain protein folded in a Rossmann manner with a central beta-sheet formed from five beta-strands and surrounded by sides by two and three alpha-helices.

Návaznosti

LC06034, projekt VaV
Název: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací