MALČÍKOVÁ, Jitka, Boris TICHÝ, Jiří DAMBORSKÝ, Jitka KABÁTHOVÁ, Martin TRBUŠEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Analysis of the DNA-binding activity of p53 mutants using functional protein microarrays and its relationship to transcriptional activation. Biological Chemistry. Berlin, DE: Walter de Gruyter&CO, 2010, roč. 391, 2/3, s. 197-205. ISSN 1431-6730.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Analysis of the DNA-binding activity of p53 mutants using functional protein microarrays and its relationship to transcriptional activation
Název česky Studium DNA-vazebné aktivity p53 mutantů pomocí funkčních proteinových čipů a vztah DNA vazby k aktivaci transkripce
Autoři MALČÍKOVÁ, Jitka (203 Česká republika, domácí), Boris TICHÝ (203 Česká republika, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, domácí), Jitka KABÁTHOVÁ (203 Česká republika, domácí), Martin TRBUŠEK (203 Česká republika, domácí), Jiří MAYER (203 Česká republika, domácí) a Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Biological Chemistry, Berlin, DE, Walter de Gruyter&CO, 2010, 1431-6730.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 30200 3.2 Clinical medicine
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.603
Kód RIV RIV/00216224:14110/10:00040758
Organizační jednotka Lékařská fakulta
UT WoS 000275194300009
Klíčová slova anglicky R337C; real-time PCR; reporter gene assay; transactivation
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441. Změněno: 23. 3. 2012 12:40.
Anotace
Sequence-specific DNA binding is the key function through which tumor suppressor p53 exerts transactivation of the downstream target genes, often being impaired in cancer cells by mutations in the TP53 gene. Functional protein microarray technology enables a high-throughput parallel analysis of protein properties within one experiment under the same conditions. Using an array approach, we analyzed the DNA binding activity of wild type p53 protein and of 49 variants. Our results show significant differences in the binding properties between the p53 mutants. The C-terminal mutant R337C displayed the highest DNA binding activity on the array. However, the same mutant showed only a partial activation in the reporter gene assay and almost no activation of downstream target genes after transfection of expression vector into cells lacking endogenous p53. These observations demonstrate that DNA binding itself is not sufficient for activating the p53 target genes in at least some of the p53 mutants and, therefore, in vitro studies might not always reflect in vivo conditions.
Anotace česky
Základním předpokladem pro účinnou transaktivaci cílových genů nádorového supresoru p53 je jeho sekvenčně-specifická vazba k DNA, jenž bývá často u nádorových buněk narušena mutacemi v genu TP53. Funkční proteinové čipy umožňují vysokokapacitní analýzu proteinových vlastností paralelně u mnoha vzorků během jediného experimentu za stejných podmínek. Pomocí čipové technologie jsme analyzovali DNA-vazebnou aktivitu wild type p53 a jeho 49 variant. Naše výsledky ukázaly významné rozdíly ve vazebných schopnostech p53 mutantů. C-koncový mutant R337C vykazoval na čipu nejvyšší vazbu k DNA. Po transfekci tohoto mutanta do p53-null buněčných linií jsme však v reportérových genových testech pozorovali pouze částečnou transaktivaci a endogenní cílové geny nebyly aktivovány téměř vůbec. Tyto výsledky ukazují, že alespoň u některých mutantů samotná vazba k DNA není dostatečná pro aktivaci cílových genů a in vitro studie proto ne vždy odráží situaci in vivo.
Návaznosti
MSM0021622412, záměrNázev: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni
MSM0021622430, záměrNázev: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
VytisknoutZobrazeno: 28. 8. 2024 17:47