MISHRA, Sushil Kumar, Jan ADAM, Michaela WIMMEROVÁ, Ruben A. ABAGYAN a Jaroslav KOČA. In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin. In Material Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology vol. 17, no 1a, 2010, page-b45. 2010.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název In silico mutagenesis and docking study of RSL lectin
Název česky Vyzkum In silico mutagenezy a dockovania RSL lectinu
Autoři MISHRA, Sushil Kumar (356 Indie, domácí), Jan ADAM (203 Česká republika, domácí), Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, domácí), Ruben A. ABAGYAN (840 Spojené státy) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Material Structure in Chemistry, Biology, Physics and Technology vol. 17, no 1a, 2010, page-b45, 2010.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/10:00043733
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova česky Docking; In silico mutagenesis; fucosylated oligosaccharides; Lectin-saccharide interactions; Binding energy.
Klíčová slova anglicky Docking;In silico mutagenesis;fucosylated oligosaccharides; Lectin-saccharide interactions; Binding energy.
Změnil Změnila: prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854. Změněno: 6. 1. 2011 16:26.
Anotace
The gram-negative bacterium Ralstonia solanacearum produces a potent L-fucose binding lectin (RSL). This work is focused on in silico mutagenesis, docking of fucose and fucosylated oligosaccharides in RSL lectin. Binding energy pattern of various saccharides was investigated by a series of docking simulations. Docking experiments were performed using the software AutoDock 3, AutoDock Vina, DOCK v.6.2 and ICM Dock. Performance of various docking programs will be discussed with respect to binding energy of those saccharides measured from SPR experiment.
Návaznosti
LC06030, projekt VaVNázev: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
ME08008, projekt VaVNázev: Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik, Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 5. 10. 2024 09:32