VALLA, Martin, Jiří NEDVĚD, Dušan PAVLÍK, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK, Libuše TRNKOVÁ, René KIZEK a Ivo PROVAZNÍK. METODY V ZÁZNAMU, HODNOCENÍ A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ FRAKTÁLY. In XIV.Setkání biochemiků a molekulárních biologů - sborník příspěvků. Brno: Masarykova univerzita, 2010, 1 s. ISBN 978-80-210-5164-5.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název METODY V ZÁZNAMU, HODNOCENÍ A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ FRAKTÁLY
Název anglicky Methods of recording, evaluation and processing of genomic signals with fractals
Autoři VALLA, Martin, Jiří NEDVĚD, Dušan PAVLÍK, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK, Libuše TRNKOVÁ, René KIZEK a Ivo PROVAZNÍK.
Vydání Brno, XIV.Setkání biochemiků a molekulárních biologů - sborník příspěvků, 1 s. 2010.
Nakladatel Masarykova univerzita
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
ISBN 978-80-210-5164-5
Klíčová slova anglicky fractals; genomic DNA
Změnil Změnila: prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc., učo 1027. Změněno: 2. 3. 2012 08:34.
Anotace
Cílem projektu je uvedení do problematiky teorie fraktálů a aplikace těchto poznatků pro analýzu obrazů získaných ze sekvence DNA kódu. Pro analýzu byly vybrány genomové sekvence kódující proteiny s afinitou k iontům kovů (metalothionein, protein p53, metaloproteinaza). Výsledkem jsou fraktální koeficienty odvozené od dimenzí struktur. Ty nám dovolují zavést kritérium pro odlišení sekvencí, multifraktální koeficient. Výstup lze také reprezentovat jako více rozměrné zobrazovaní a záznam genomického signálu (1D, 2D a 3D). Všechny algoritmy byly vytvořeny v prostředí maticové laboratoře MATLAB.
Anotace anglicky
Aim of interest consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Results of calculation are fractal coefficients derived from dimensions of generated structures. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB.
Návaznosti
KAN208130801, projekt VaVNázev: Nové konstrukce a využití nanobiosenzorů a nanosenzorů v medicíně (NANOSEMED)
LC06035, projekt VaVNázev: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu
VytisknoutZobrazeno: 16. 8. 2024 10:14