2010
METODY V ZÁZNAMU, HODNOCENÍ A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ FRAKTÁLY
VALLA, Martin, Jiří NEDVĚD, Dušan PAVLÍK, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK et. al.Základní údaje
Originální název
METODY V ZÁZNAMU, HODNOCENÍ A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ FRAKTÁLY
Název anglicky
Methods of recording, evaluation and processing of genomic signals with fractals
Autoři
VALLA, Martin, Jiří NEDVĚD, Dušan PAVLÍK, Vojtěch ADAM, Jaromír HUBÁLEK, Libuše TRNKOVÁ, René KIZEK a Ivo PROVAZNÍK
Vydání
Brno, XIV.Setkání biochemiků a molekulárních biologů - sborník příspěvků, 1 s. 2010
Nakladatel
Masarykova univerzita
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
ISBN
978-80-210-5164-5
Klíčová slova anglicky
fractals; genomic DNA
Změněno: 2. 3. 2012 08:34, prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc.
V originále
Cílem projektu je uvedení do problematiky teorie fraktálů a aplikace těchto poznatků pro analýzu obrazů získaných ze sekvence DNA kódu. Pro analýzu byly vybrány genomové sekvence kódující proteiny s afinitou k iontům kovů (metalothionein, protein p53, metaloproteinaza). Výsledkem jsou fraktální koeficienty odvozené od dimenzí struktur. Ty nám dovolují zavést kritérium pro odlišení sekvencí, multifraktální koeficient. Výstup lze také reprezentovat jako více rozměrné zobrazovaní a záznam genomického signálu (1D, 2D a 3D). Všechny algoritmy byly vytvořeny v prostředí maticové laboratoře MATLAB.
Anglicky
Aim of interest consists in image analysis obtained from linear sequence of DNA code. For analysis itself, sequences of Homo sapiens Atlase and Citrobacter youngae were chosen. Results of calculation are fractal coefficients derived from dimensions of generated structures. This result enables to introduce criterion for sequences determination. Graphical outputs may be also represented as multidimensional alternative transformation of linearly recorded genomic signal. Algorithms are developed in environment of matrix laboratory MATLAB.
Návaznosti
| KAN208130801, projekt VaV |
| ||
| LC06035, projekt VaV |
|