The evolution of base composition in monocots

ŠMARDA, Petr, Petr BUREŠ a Lucie HOROVÁ. The evolution of base composition in monocots. In Structural and functional diversity of the eukaryotic genome. Brno: muni press, 2010, s. 69-69, 2 s. ISBN 978-80-210-5285-7.

Základní údaje

Originální název

The evolution of base composition in monocots

Autoři

ŠMARDA, Petr (203 Česká republika, garant, domácí), Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí) a Lucie HOROVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Brno, Structural and functional diversity of the eukaryotic genome, od s. 69-69, 2 s. 2010

Nakladatel

muni press

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Kód RIV

RIV/00216224:14310/10:00045128

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-210-5285-7

Klíčová slova česky

evoluce velikosti genomu; složení DNA bazí; GC obsah, jednoděložné, Poaceae

Klíčová slova anglicky

genome size evolution; base composition; GC content; monocots; Poaceae

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

Compared to other known angiosperms, monocots genomes show considerable variation in the base composition. This variation may reasoned in compositional changes of the genome and/or various selection forces operating on the molecular level. Here we present the update of CG content data with flow cytometry in majority of monocot families. Monocots have been formerly assumed to have higher GC content compared to other angiosperms, however, this relationship was assumed based on limited genomic data. Our preliminary results indicate that most monocot families indeed posses higher GC content that those known up to date in dicots. A remarkable increase of GC content in grasses seems not to start before the divergence of grasses from Joinvilleaceae. In addition to grasses, several other considerable changes in the overall GC content may be observed in several other monocot groups. We show that combination of GC content and genome size data may provide a useful tool for tracking the long-term processes of genome evolution and may help also in taxa identification and classification.

---

Návaznosti

GP206/08/P222, projekt VaV	Název: Evoluce GC obsahu a genomu trav Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav
LC06073, projekt VaV	Název: Centrum pro výzkum biodiverzity Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr	Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase