J 2006

Localization of genetic elements of intact and derivative chromosome 11 and 22 territories in nuclei of Ewing sarcoma cells

TASLEROVÁ, Renata, Stanislav KOZUBEK, Eva BÁRTOVÁ, Pavla GAJDUŠKOVÁ, Roman KODET et. al.

Základní údaje

Originální název

Localization of genetic elements of intact and derivative chromosome 11 and 22 territories in nuclei of Ewing sarcoma cells

Autoři

TASLEROVÁ, Renata (203 Česká republika), Stanislav KOZUBEK (203 Česká republika, garant), Eva BÁRTOVÁ (203 Česká republika), Pavla GAJDUŠKOVÁ (203 Česká republika), Roman KODET (203 Česká republika) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika)

Vydání

Journal of Structural Biology, San Diego,USA, Academic Press, 2006, 1047-8477

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 3.496

Kód RIV

RIV/00216224:14330/06:00040618

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

UT WoS

000241168000009

Klíčová slova anglicky

HIGH-RESOLUTION CYTOMETRY; HUMAN LEUKEMIC-CELLS; HUMAN-LYMPHOCYTES; EXCHANGE ABERRATIONS; SPATIAL-ORGANIZATION; INTERPHASE NUCLEUS; BCR GENES; DOMAINS; CYCLE; TOPOGRAPHY

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 30. 10. 2010 11:09, prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D.

Anotace

V originále

Recurring chromosomal abnormalities are associated with specific tumour types. The EWSR1 and FLI1 genes are involved in balanced translocation t(11;22)(q24;q12), which is present in more than 85% of Ewing sarcomas. In our previous study, we have found that the fusion genes pertaining to both derivative chromosomes 11 and 22 in Ewing sarcoma cell nuclei are shifted to the midway nuclear position between the native EWSR1 and FLI1 genes. In this contribution we focused our attention at nuclear positioning of other genetic elements of chromosomes 11 and 22 in order to find if the whole derivative chromosomes or only their translocated parts change their nuclear positions in comparison with the native chromosomes. Using repeated fluorescence in situ hybridization and high-resolution cytometry, 2D radial positions of EWSR1, BCR, FLI1, BCL1 genes and fluorescence weight centres of chromosome territories were compared for intact and derivative chromosomes 11 and 22 in nuclei of three Ewing sarcoma samples. Significant radial shift was obtained for the derivative EWSR1, FLI1 and BCL1 genes and for the derivative chromosome 11 compared with the intact ones and not very significant for chromosome 22 and the BCR gene. Our results also suggest that the mean nuclear positions of fusion genes are determined by the final structure of the derivative chromosomes and do not depend on the location of the translocation event. (c) 2006 Elsevier Inc. All rights reserved.

Návaznosti

GA202/04/0907, projekt VaV
Název: Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
Investor: Grantová agentura ČR, Cytometrie s vysokým rozlišením na živých buňkách
IAA5004306, projekt VaV
Název: Struktura lidského genomu
Investor: Akademie věd ČR, Struktura lidského genomu
LC535, projekt VaV
Název: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM 143300002, záměr
Název: Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii
1A8241, projekt VaV
Název: Nové možnosti diagnostiky leukémií s využitím technologie DNA-mikročipů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Nové možnosti diagnostiky leukémie s využitím technologie DNA-mikročipů