2010
Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire
TESAŘOVÁ, Lenka, Martina PETERKOVÁ, Stanislav STEJSKAL, Michaela POTĚŠILOVÁ, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ et. al.Základní údaje
Originální název
Application of reverse transcription PCR and capillary electrophoresis in the analysis of T-cell receptor beta variable repertoire
Název česky
Aplikace RT-PCR a kapilární elektroforézy při analýze TCR beta variabilního repertoáru
Autoři
TESAŘOVÁ, Lenka (203 Česká republika, domácí), Martina PETERKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stanislav STEJSKAL (203 Česká republika, domácí), Michaela POTĚŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Česká republika, garant, domácí)
Vydání
Brno, Česká republika, Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010, od s. 46-51, 6 s. 2010
Nakladatel
muni PRESS
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
tištěná verze "print"
Kód RIV
RIV/00216224:14330/10:00045361
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
ISBN
978-80-210-5312-0
Klíčová slova česky
RT-PCR; Kapilární elektroforéza; T-buněčný receptor; BV genové rodiny
Klíčová slova anglicky
Reverse transcription polymerase chain reaction; Capillary electrophoresis; T-cell receptor; Beta variable families
Štítky
Příznaky
Recenzováno
Změněno: 8. 4. 2014 07:50, Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D.
V originále
Monitoring the T-cell population diversity has demonstrated to be beneficial when evaluating an individuals immune status. BV families are most often analysed to examine this diversity. The aim of our study was to establish a method for specific determination of relative BV family expression and to evaluate its applicability in terms of multiple myeloma (MM). Peripheral blood mononuclear cells from healthy donors and MM patients were analysed by RT-PCR. PCR product amounts were determined with an Agilent 2100 Bioanalyzer utilizing capillary electrophoresis and converted to the relative BV family expression. This report provides reverse transcription PCR with primers allowing for the analysis of the entire BV family repertoire. Further it describes the utilization of capillary electrophoresis to evaluate the relative BV family expression after their amplification. The methodology is fast and simple to operate and is therefore suitable as a first screening of the T-cell population composition.
Česky
Prokázalo se, že sledovat diverzitu populace T lymfocytů je výhodné v mnoha klinických podmínkách, kdy se hodnotí stav imunitního systému jedince. Nejčastěji se analyzují BV rodiny. Cílem studie bylo zavést metodiku pro specifické stanovení relativní exprese BV rodin a vyhodnotit její použitelnost v podmínkách mnohočetného myelomu. Pomocí RT-PCR se analyzovali vzorky periferní krve od zdravých dárců a pacientů s mnohočetným myelomem. Množství PCR produktů bylo stanoveno pomocí přístroje Agilent 2100 Bioanalyzer a převedeno na relativní expresi BV rodin. Tato práce poskytuje RT-PCR s primery, které umožňují analýzu celého repertoáru BV rodin. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy při vyhodnocení relativní exprese BV rodin po jejich amplifikaci. Metodika je rychlá a jednoduchá, tudíž vhodná na první skrínink složení populace T lymfocytů. Dokázali jsme její schopnost detekovat změny v repertoáru BV rodin u pacientů s mnohočetným myelomem v porovnání s poměrně stabilním profilem u zdravých dárců.
Návaznosti
| MSM0021622430, záměr |
| ||
| 2B06052, projekt VaV |
|