2010
A novel approach to evaluation of the spatial relationship of fluorescent signals in ImunnoFISH analysis of different kind.
STEJSKAL, Stanislav, Pavel MATULA, Ondřej DANĚK, Martin MAŠKA, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ et. al.Základní údaje
Originální název
A novel approach to evaluation of the spatial relationship of fluorescent signals in ImunnoFISH analysis of different kind.
Autoři
STEJSKAL, Stanislav (203 Česká republika, domácí), Pavel MATULA (203 Česká republika, domácí), Ondřej DANĚK (203 Česká republika, domácí), Martin MAŠKA (203 Česká republika, domácí), Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Česká republika, garant, domácí) a Michal KOZUBEK (203 Česká republika, domácí)
Vydání
Brno, Advances in Molecular and Cancer Biology, 2010, od s. 39-41, 3 s. 2010
Nakladatel
muni PRESS
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Stať ve sborníku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Forma vydání
tištěná verze "print"
Kód RIV
RIV/00216224:14330/10:00045380
Organizační jednotka
Fakulta informatiky
ISBN
978-80-210-5312-0
Klíčová slova anglicky
confocal microscopy; image analysis; fluorescent in situ hybridisation; immunoflourescence; nucleus
Příznaky
Recenzováno
Změněno: 13. 12. 2015 02:07, doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D.
Anotace
V originále
Confocal fluorescence microscopy enables the study and observation of the different structures in the cell in the high resolution. Its role in epigenetic research is finding spatial distribution and interaction of factors that can affect gene expression without change in genetic code. Combination of specific staining of DNA sequences and nuclear proteins (ImmunoFISH) help us to describe the protein distribution in the neighbourhood of targeted genes. In our early studies we had focused on the mutual spatial relation between genetic loci with described genetic activity and nuclear proteins commonly linked with the regulation of gene activity. Unfortunately, a broad distribution of the protein signal disabled the classical co-localisation analysis and we had to find an alternative approach for image analysis. Output of the presented image analysis is helpful for the co-localisation analysis of image data with broad distribution of signal and suitable for statistical analysis. All steps of analysis were implemented into the Acquiarium software.
Návaznosti
| MSM0021622430, záměr |
| ||
| 2B06052, projekt VaV |
|