J 2010

PCR vyšetření tekutiny z bronchoalveolární laváže pro detekci invazivních mykotických infekcí

HRNČÍŘOVÁ, Kristýna; Martina LENGEROVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Zdeněk RÁČIL; Jiří MAYER et. al.

Basic information

Original name

PCR vyšetření tekutiny z bronchoalveolární laváže pro detekci invazivních mykotických infekcí

Name (in English)

Examination of bronchoalveolar lavage fluid for diagnostics of invasive fungal diseases

Authors

HRNČÍŘOVÁ, Kristýna (203 Czech Republic, belonging to the institution); Martina LENGEROVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution); Iva KOCMANOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution); Zdeněk RÁČIL (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution) and Jiří MAYER (203 Czech Republic, belonging to the institution)

Edition

Postgraduální medicína, Praha, Mladá fronta a.s. 2010, 1212-4184

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Article in a journal

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

is not subject to a state or trade secret

RIV identification code

RIV/00216224:14110/10:00040201

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords (in Czech)

invazivní mykotické infekce; PCR; DNA; diagnostika

Keywords in English

invasive fungal infections; PCR; DNA; diagnostics
Changed: 21/11/2011 19:37, prof. MUDr. Zdeněk Ráčil, Ph.D.

Abstract

V originále

Přestože se PCR diagnostika mykotických infekcí stále vyvíjí a není doposud nijak standardizovaná, hraje významnou roli a je vhodným doplněním stávajících diagnostických metod. Vysoká citlivost PCR metod je bohužel spojena také s vysokým rizikem kontaminace vzorků mikromycetami z prostředí v průběhu celého procesu izolace DNA až po vlastní PCR amplifikaci. Je tedy důležité používat specifické metody, dbát ve vysoké míře na dodržování protikontaminačních opatření a v neposlední řadě používat pro diagnostiku kvantitativní metody, které umožňují stanovit nálož fungální DNA ve vzorku, což je důležité pro odlišení případné kolonizace/kontaminace od aktivní infekce. Veškeré výsledky získané pomocí PCR metodik je zapotřebí vždy interpretovat v kontextu s výsledky ostatních diagnostických metod.

In English

Although the PCR diagnostics of fungal infections is still evolving and is not yet standardized, plays an important role and is the appropriate completion of existing diagnostic methods. High sensitivity of PCR methods is unfortunately associated also with high risk of contamination the samples with micromycetes from surrounding during the process of DNA isolation and PCR amplification. It is so important to use specific methods, to enforce anticontamination measures in high degree and ultimately to use quantitative methods for the diagnostics, that enable to determine the load of fungal DNA in sample, which is important to distinguish possible colonization/contamination from active infection. All results obtained by PCR methods is always necessary to interpret in context with results of other diagnostic methods.

Links

FR-TI2/254, research and development project
Name: *Real-time PCR soupravy pro diagnostiku v onkologii (Acronym: ONKOKITY)
Investor: Ministry of Industry and Trade of the CR
MUNI/A/1012/2009, interní kód MU
Name: Optimalizace diagnostiky a terapie maligních chorob a komplikací, které tyto maligní nemoci provázejí, s využitím nových molekulárně biologických metod.
Investor: Masaryk University, Category A
NS10441, research and development project
Name: Monitorování plazmatických hladin vorikonazolu
NS10442, research and development project
Name: Využití nekultivačních metod pro diagnostiku invazivních mykotických infekcí způsobených vláknitými houbami z materiálu získaného bronchoalveolární laváží u hematoonkologických pacientů