Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase
DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase. In Higher European Research Course for Users of Large Experimental Systems (HERCULES). 2011. |
Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
|
Základní údaje | |
---|---|
Originální název | Crystallization and structure determination of delta-subunit of RNApolymerase |
Název česky | Krystalizace a určení struktury delta-podjednotky RNA polymerázy |
Autoři | DEMO, Gabriel (703 Slovensko, domácí), Veronika PAPOUŠKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Hana ŠANDEROVÁ (203 Česká republika), Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, domácí) a Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, garant, domácí). |
Vydání | Higher European Research Course for Users of Large Experimental Systems (HERCULES), 2011. |
Další údaje | |
---|---|
Originální jazyk | angličtina |
Typ výsledku | Konferenční abstrakt |
Obor | 10600 1.6 Biological sciences |
Stát vydavatele | Česká republika |
Utajení | není předmětem státního či obchodního tajemství |
Kód RIV | RIV/00216224:14740/11:00049774 |
Organizační jednotka | Středoevropský technologický institut |
Klíčová slova česky | delta-podjednotka RNA polymeráza krystalizace struktura |
Klíčová slova anglicky | delta-subunit RNA polymerase crystallization structure |
Štítky | rivok |
Změnil | Změnil: Mgr. Gabriel Demo, Ph.D., učo 150765. Změněno: 8. 5. 2011 12:10. |
Anotace |
---|
The structure of N-terminal domain was determined by NMR. It consists mainly of three alpha-helixes and one short beta-sheet, yet the N-terminal part remains unstructured. The cause of this flexibility is probably the His6-Tag attached at the N-terminus.The N-terminal domain of delta subunit was conquested to high-throughput screening (sitting drop), where several crystallization conditions were found.Higher quality crystals were obtained after 7-9 days with an average size 150 x 100 micrometers.Diffraction data were collected at ESRF Grenoble, ID-23. The resolution of the structure was 3.5 Angstrom. The data were processed by MOSFLM and the determination of the structure was done by molecular replacement with NMR structure used as a model. |
Anotace česky |
---|
Struktura N-terminální domény byla určená NMR. Její struktura je tvořena 3 alfa-helixy a jedním krátkym beta-listem. Část domény zůstáva neuspořádaná, pravděpodobně díky flexibilnímu konci His6-Tag. Přistoupilo se ke krystalizaci N-terminální domény, kde byli najdeny krystalizační podmínky pro získání krystalu. Krystaly byli získany po 7-9 dnech s průměrnou velikostí 150 x 100 mikrometru. Difrakční data byli naměřeny na ESRF v Grenobli na ID-23. Rozlišení dat bylo 3.5 Angstrom. Data byli spracovány programem MOSFLM a struktura delta podjednotky byla určená molekulárním nahrazením za použití NMR struktury jako modelu. |
Návaznosti | |
---|---|
GA204/09/0583, projekt VaV | Název: Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií (Akronym: DELTA) |
Investor: Grantová agentura ČR, Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií | |
GD301/09/H004, projekt VaV | Název: Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny |
Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny | |
MSM0021622413, záměr | Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím |
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím |
VytisknoutZobrazeno: 15. 10. 2024 09:47