Reconstitution of DNA repair synthesis in vitro and the role of polymerase and helicase activities

ŠEBESTA, Marek, Peter BURKOVICS, Lajos HARACSKA a Lumír KREJČÍ. Reconstitution of DNA repair synthesis in vitro and the role of polymerase and helicase activities. DNA Repair. 2011, roč. 10, č. 6, s. 567-576. ISSN 1568-7864. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.dnarep.2011.03.003.

Základní údaje

Originální název

Reconstitution of DNA repair synthesis in vitro and the role of polymerase and helicase activities

Autoři

ŠEBESTA, Marek (703 Slovensko, domácí), Peter BURKOVICS (348 Maďarsko), Lajos HARACSKA (348 Maďarsko) a Lumír KREJČÍ (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

DNA Repair, 2011, 1568-7864

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 4.135

Kód RIV

RIV/00216224:14110/11:00049878

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

DOI

http://dx.doi.org/10.1016/j.dnarep.2011.03.003

UT WoS

000292440800002

Klíčová slova anglicky

DNA repair; Recombination; DNA synthesis; Replication; Mph1 Srs2

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Anotace

V originále

The error-free repair of double-strand DNA breaks by homologous recombination (HR) ensures genomic stability using undamaged homologous sequence to copy genetic information. While some of the aspects of the initial steps of HR are understood, the molecular mechanisms underlying events downstream of the D-loop formation remain unclear. Therefore, we have reconstituted D-loop-based in vitro recombinationassociated DNA repair synthesis assay and tested the efficacy of polymerases Pol and Pol to extend invaded primer, and the ability of three helicases (Mph1, Srs2 and Sgs1) to displace this extended primer. Both Pol and Pol extended up to 50% of the D-loop substrate, but differed in product length and dependency on proliferating cell nuclear antigen (PCNA). Mph1, but not Srs2 or Sgs1, displaced the extended primer very efficiently, supporting putative role ofMph1in promoting the synthesis-dependent strand-annealing pathway. The experimental system described here can be employed to increase our understanding of HR events following D-loop formation, as well as the regulatory mechanisms involved.

---

Návaznosti

GA301/09/1917, projekt VaV	Název: Štěpení replikačních-rekombinačních DNA meziproduktů a jejich úloha při nestabilitě genomu Investor: Grantová agentura ČR, Štěpení replikačních-rekombinačních DNA meziproduktů a jejich úloha při nestabilitě genomu
GD203/09/H046, projekt VaV	Název: Biochemie na rozcestí mezi in silico a in vitro Investor: Grantová agentura ČR, Biochemie na rozcestí mezi in silico a in vitro
LC06030, projekt VaV	Název: Biomolekulární centrum Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
ME10048, projekt VaV	Název: Vliv post-translačních modifikací na DNA opravu a rekombinaci. Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vliv post-translačních modifikací na DNA opravu a rekombinaci., Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)