a 2011

The evolution and meaning of DNA base composition in monocots

ŠMARDA, Petr a Petr BUREŠ

Základní údaje

Originální název

The evolution and meaning of DNA base composition in monocots

Název česky

Evoluce a význam složení DNA bazí u jednoděložných

Autoři

ŠMARDA, Petr (203 Česká republika, garant, domácí) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

6. konference Analytická cytometrie, 2011

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00050068

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-260-0676-3

Klíčová slova česky

GC content; plant DNA base composition; genome evolution; flow cytometry

Klíčová slova anglicky

GC obsah; DNA kompozice rostlinných genomů; evoluce genomu; průtoková cytometrie

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 18. 10. 2011 12:02, Mgr. Petr Šmarda, Ph.D.

Anotace

V originále

Research on the base composition has long tradition in microbial research where base composition represents a significant classification criterion and similarly to genome size it represents an important predictor of species ecology. A similar research on the magnitude and dynamics of genome evolution in respect of base composition (DNA quality) is widely lacking in plants. Here we present results of measurements of GC content and genome sizes across a nearly complete phylogenetical family representation of monocots. This model group shows an extreme genome diversity comprising both species with absolutely lowest (Cyperaceae clade) and highest (Poaceae, Xyridaceae+Eriocaulaceae clade) GC contents known to date. The results of our pilot analyses using phylogenetical comparative methods are present which test how speed of GC content and genome size evolution may vary across various lineages of monocots and climatic regions, and to what extent the speed of genome evolution may be determined or reflected with specific life strategies and species ecology.

Návaznosti

GAP506/11/0890, projekt VaV
Název: Evoluce kompozice DNA bazí u vyšších rostlin (Akronym: GCobsah)
Investor: Grantová agentura ČR, Evolution of base composition in land plants
GP206/08/P222, projekt VaV
Název: Evoluce GC obsahu a genomu trav
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav
LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase