a 2011

A solution study of protonation chemical equlibria of nucleobases and short oligonucleotides

LUBAL, Přemysl, Sylvie HOLUBOVÁ a Libuše TRNKOVÁ

Základní údaje

Originální název

A solution study of protonation chemical equlibria of nucleobases and short oligonucleotides

Autoři

LUBAL, Přemysl (203 Česká republika, garant, domácí), Sylvie HOLUBOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Libuše TRNKOVÁ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

Biopolymers: Structure and dynamics, A biophysical workshop, 2011

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00053670

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-263-0050-2

Klíčová slova anglicky

oligonucleotides;cytosine;adenine;molecular spectroscopy;equispec;opium

Štítky

Změněno: 13. 4. 2012 12:24, prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc.

Anotace

V originále

The protonation constants of nucleobases and relevant nucleosides and nucleotides were determined by means of potenciometry and molecular absorption spectroscopy in UV region (I=0.15 mol.l-1 NaCl,t=25C) and the experimental data were evaluated by OPIUM program. In addition, thermodynamic parameters for nucleobase ligands were estimated. Also, some examples of ligand complexation by transition metal ions (e.g. copper(II),zinc(II),kadmium(II)) will be presented and their importance for bioligand speciation will be discussed. The protonation behavior of ODN containing C, i.e.(CCC)n,n=1–3, was followed by means of molecular spectroscopy in pH region 2–8 and variable temperature and ionic strength adjusted by NaCl. The experimental data were treated by means of OPIUM, MCR – ALS and EQUISPEC software and distribution diagram of species as pH fuction were calculated. For comparison, the protonation behavior of ODN with the (CAC)3, A3C3C3 and C3A3C3 sequence was also investigated. The influence of the structural motif and length on protonation constants o studied ODN seems to be very important due to probace stabilization of the secondary structure of the biomacromolecule.

Návaznosti

LC06035, projekt VaV
Název: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu
ME09065, projekt VaV
Název: Výzkum nových detekčních systémů na bázi senzorových polí pro použití ve speciační analýze
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkum nových detekčních systémů na bázi senzorových polí pro použití ve speciační analýze, Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)
MUNI/A/0992/2009, interní kód MU
Název: Vývoj metodologie a instrumentace analytické chemie pro studium složení a vlastností přírodních a syntetických materiálů (Akronym: MIA)
Investor: Masarykova univerzita, Vývoj metodologie a instrumentace analytické chemie pro studium složení a vlastností přírodních a syntetických materiálů, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty