2011
Pandoraea oxalativorans sp. nov., Pandoraea faecigallinarum sp. nov. and Pandoraea vervacti sp. nov., isolated from oxalate-enriched culture
SAHIN, Nurettin, Akio TANI, Recep KOTAN, Ivo SEDLÁČEK, Kazuhide KIMBARA et. al.Základní údaje
Originální název
Pandoraea oxalativorans sp. nov., Pandoraea faecigallinarum sp. nov. and Pandoraea vervacti sp. nov., isolated from oxalate-enriched culture
Název česky
Pandoraea oxalativorans sp. nov., Pandoraea faecigallinarum sp. nov. a Pandoraea vervacti sp. nov., izolovány z oxalatem-obohacených kultur
Autoři
SAHIN, Nurettin (792 Turecko), Akio TANI (392 Japonsko), Recep KOTAN (792 Turecko), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, garant, domácí), Kazuhide KIMBARA (392 Japonsko) a Abdurrahman TAMER (792 Turecko)
Vydání
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, SGM, 2011, 1466-5026
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.268
Kód RIV
RIV/00216224:14310/11:00054657
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
000295432300038
Klíčová slova česky
Pandoraea; Taxonomie
Klíčová slova anglicky
Pandoraea; Taxonomy
Změněno: 5. 4. 2012 13:31, Ing. Andrea Mikešková
V originále
Five isolates, designated TA2, TA4, TA25(T), KOx(T) and NS15(T) were isolated in previous studies by enrichment in mineral medium with potassium oxalate as the sole carbon source and were characterized using a polyphasic approach. The isolates were Gram-reaction-negative, aerobic, non-spore-forming rods. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA and DNA gyrase B subunit (gyrB) gene sequences confirmed that the isolates belonged to the genus Pandoraea and were most closely related to Pandoraea sputorum and Pandoraea pnomenusa (97.2-99.70/0 16S rRNA gene sequence similarity). The isolates could be differentiated from their closest relatives on the basis of several phenotypic characteristics. The major cellular fatty acid profiles of the isolates comprised C(16:0), C(18:1)omega 7c, C(17:0) cyclo and summed feature 3 (C(16:1)omega 7c and/or iso-C(15:0) 2-OH). On the basis of DNA DNA hybridization studies and phylogenetic analyses, the isolates represent three novel species within the genus Pandoraea, for which the names Pandoraea oxalativorans sp. nov. (TA25(T) =NBRC 106091(T) =CCM 7677(T) =DSM 23570(T)), Pandoraea faecigallinarum sp. nov. (KOx(T) =NBRC 106092(T) =CCM 2766(T) =DSM 23572(T)) and Pandoraea vervacti sp. nov. (NS15(T) =NBRC 106088(T) =CCM 7667(T) =DSM 235711) are proposed.
Česky
Pět izolátů označených TA2, TA4, TA25(T), KOx(T) a NS15(T) bylo charakterizováno polyfázovým přístupem. Na základě DNA-DNA hybridizačních studií a fylogenetických analýz bylo prokázáno, že izoláty reprezentují tři nové druhy rodu pandoraea - Pandoraea oxalativorans sp. nov. (TA25(T) =NBRC 106091(T) =CCM 7677(T) =DSM 23570(T)), Pandoraea faecigallinarum sp. nov. (KOx(T) =NBRC 106092(T) =CCM 2766(T) =DSM 23572(T)) a Pandoraea vervacti sp. nov. (NS15(T) =NBRC 106088(T) =CCM 7667(T) =DSM 235711).
Návaznosti
| MSM0021622416, záměr |
|