KANICKÝ, Viktor, Jan HAVLIŠ, Paul EK, Tomáš VACULOVIČ a Hana NEJEZCHLEBOVÁ. Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů prometaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem. Chemicke listy. Česká republika: Česká společnost chemická, 2011, roč. 105, č. 11, s. 896-902. ISSN 0009-2770.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů prometaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem
Název česky Kryogenická postseparační úprava polyakrylamidových gelů prometaloproteomické analýzy kombinací gelové elektroforézy, laserové ablace a hmotnostní spektrometrie s ionizací indukčně vázaným plazmatem
Název anglicky Cryogenic Postseparation Treatment of Acrylamide Gels for Metaloproteomic Analyses by Combination of Gel Electrophoresis, Laser Ablation and Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry
Autoři KANICKÝ, Viktor (203 Česká republika, garant, domácí), Jan HAVLIŠ (203 Česká republika, domácí), Paul EK (246 Finsko), Tomáš VACULOVIČ (203 Česká republika, domácí) a Hana NEJEZCHLEBOVÁ (203 Česká republika, domácí).
Vydání Chemicke listy, Česká republika, Česká společnost chemická, 2011, 0009-2770.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10406 Analytical chemistry
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW paper summary
Impakt faktor Impact factor: 0.529
Kód RIV RIV/00216224:14310/11:00050344
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000297567400013
Klíčová slova česky gelová elektroforéza;laserová ablace;indukčně vázané plazma;hmotnostní spektrometrie;metaloprotein;kov vázající protein;kryogenická ablační cela;celofánová fólie;sušení gelu
Klíčová slova anglicky gel electrophoresis;laser ablation;inductively coupled plasma;mass spectrometry;metalloprotein;metal binding protein;cryogenic ablation cell;cellophane foil;gel drying
Štítky AKR, rivok
Příznaky Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 20. 4. 2012 11:57.
Anotace
Analýza kovových specií v kryogenicky zmrazených gelech pocházejících ze separace polyakrylamidovou gelovou elektroforézou provedená laserovou ablací spojenou s hmotnostní spektrometrií a indukčně vázaným plazmatem (GLIM) byla studována pro identifikaci a kvantifikaci separovaných metaloproteinů. Bylo provedeno srovnání s tradičními způsoby sušení gelů před ablací (běžné sušení, sušení gelu mezi dvěma celofánovými fóliemi), které jsou nezbytné před laserovou ablací, aby se zabránilo nežádoucím interferencím týkajícím se produkce plynu při laserové ablaci gelu z jeho kapalného obsahu. Laserová ablace gelů v kryogenní ablační cele (-80 st. C, 25 min) s obsahem BSA-Co 1:1 a ADH se Zn (II) je relevantní alternativou k tradičním způsobům, protože významně šetří čas (až desítky hodin namísto dnů), poskytuje srovnatelné s výsledky ve smyslu vysokých intenzit signálů a nízkých RSD v ICP-MS a umožňuje vícenásobné použití gelu po kryogenní ablaci, např. pro hmotnostní spektrometrií řízenou identifikaci aproteinu.
Anotace anglicky
Analysis of metal species in cryogenic frozen gels originated in polyacrylamide gel electrophoresis by laser ablation connected to inductively coupled plasma mass spectrometry has been investigated to detect/quantitate them in separated metalloproteins. It was compared to traditional ways of gel drying procedures prior to ablation (plain drying, drying gel sandwiched between two cellophane foils), which are necessary operations before laser ablation to prevent undesired interferences related to gas production during laser ablation because of liquid content. Laser ablation of the gels containing BSA:Co 1:1 and ADH with Zn in cryogenic ablation cell (–80 deg. C, 25 min) is a relevant alternative to the traditional procedures because of significant time spared during the procedure (down to tens of hours instead of days), it yields comparable outcome of metal species analysis by means of their high signal intensities and low RSD in ICP-MS and because of reusability of gels after cryogenic ablation, e.g. for mass spectrometry driven identification of protein moiety of metalloprotein.
Návaznosti
GA203/07/1391, projekt VaVNázev: Vývoj nových metod pro charakterizaci metaloproteinů
Investor: Grantová agentura ČR, Vývoj nových metod pro charakterizaci metaloproteinů
MSM0021622412, záměrNázev: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
VytisknoutZobrazeno: 7. 5. 2024 03:26