J 2011

Role of Everlasting Triplet Expansions in Protein Evolution

KOREN, Zohar a Eduard TRIFONOV

Základní údaje

Originální název

Role of Everlasting Triplet Expansions in Protein Evolution

Autoři

KOREN, Zohar (376 Izrael) a Eduard TRIFONOV (376 Izrael, garant, domácí)

Vydání

Journal of molecular evolution. New York, Springer, 2011, 0022-2844

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.274

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00054893

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

UT WoS

000288808400011

Klíčová slova anglicky

Codon usage; Evolutionary play-ground; Fast adaptation; First exons; Genome inflation; Homopeptides; Selfish DNA; Tandem repeats; Triplet code; Triplet expansion disorders

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 25. 3. 2012 07:59, Olga Křížová

Anotace

V originále

Analysis of occurrence of simple amino acid repeats in large ensemble of prokaryotic and eukaryotic sequences reveals that nearly all amino acids found in the repeats belong to those which have in their codon repertoires aggressively expanding triplets, all of three known pathologically expanding classes GCU (GCU, CUG, UGC, AGC, GCA, CAG), GCC (GCC, CCG, CGC, GGC, GCG, CGG), and AAG (AAG, AGA, GAA, CTT, TTC, TCT).The spontaneous expansions continued to occur all the way during evolution, leaving their footprints in the protein-coding sequences as still visible simple amino acid repeats, as preferred triplets encoding the repeats, and as preferred codons in the codon usage tables.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací