2011
Role of Everlasting Triplet Expansions in Protein Evolution
KOREN, Zohar a Eduard TRIFONOVZákladní údaje
Originální název
Role of Everlasting Triplet Expansions in Protein Evolution
Autoři
KOREN, Zohar (376 Izrael) a Eduard TRIFONOV (376 Izrael, garant, domácí)
Vydání
Journal of molecular evolution. New York, Springer, 2011, 0022-2844
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele
Spojené státy
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 2.274
Kód RIV
RIV/00216224:14740/11:00054893
Organizační jednotka
Středoevropský technologický institut
UT WoS
000288808400011
Klíčová slova anglicky
Codon usage; Evolutionary play-ground; Fast adaptation; First exons; Genome inflation; Homopeptides; Selfish DNA; Tandem repeats; Triplet code; Triplet expansion disorders
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 25. 3. 2012 07:59, Olga Křížová
Anotace
V originále
Analysis of occurrence of simple amino acid repeats in large ensemble of prokaryotic and eukaryotic sequences reveals that nearly all amino acids found in the repeats belong to those which have in their codon repertoires aggressively expanding triplets, all of three known pathologically expanding classes GCU (GCU, CUG, UGC, AGC, GCA, CAG), GCC (GCC, CCG, CGC, GGC, GCG, CGG), and AAG (AAG, AGA, GAA, CTT, TTC, TCT).The spontaneous expansions continued to occur all the way during evolution, leaving their footprints in the protein-coding sequences as still visible simple amino acid repeats, as preferred triplets encoding the repeats, and as preferred codons in the codon usage tables.
Návaznosti
MSM0021622415, záměr |
|